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肝類臘質變性
本病多發生在集約式養殖型態，尤其在鮭鱒類，虹鱒特別容易發生。
1.病因：飼料中含過量的不飽和脂肪酸。
a.餵飼品質不良之飼料（例如腐敗含臭油味的魚粉及肉骨粉），飼料中含大量過氧化的不飽和脂肪酸，破壞魚體的Vit.A及E（尤其Vit. E為天然的強抗氧化劑，
在正常的情況下可保護細胞膜的脂肪酸）。
b.集約養殖的魚類，因過多的脂肪堆積於肝細胞，當不飽和脂肪酸大量增加時，由於缺乏生物的抗氧化劑，引發自體氧化作用（self-cxidation）而形成類臘質
（ceroid），類臘質為黃棕色的色素，堆積在肝細胞造成肝類臘質變性。
Ceroid最早在1941年於肝硬化的小白鼠發現，在H&E切片下，它是黃色顆粒
狀色素，其特性為：在石腊切片下為嗜蘇丹紅（sudanphilic）、抗酸性（acid-fast）、
嗜鹼性（basophilic）、等向性（isotropic）、鐵為陰性（iron negtive），為脂溶性，
不溶於水及酒精，以麥洛利氏血棕質染色（Mallory’s hemofuscin stain）及魏勾
德氏髓鞘染色（Weigert’s myelin stain）皆陽性，可還原鋨酸酐（Osmium tetroxide）
及碳酸二胺銀（diamine silver carbonate），但無法還原亞鐵氰化鐵（ferric
ferricyanide），格美林氏反應（Gmelin reaction）為陰性，於波長3650-3660Å可
見黃綠色螢光，在過甲酸或過碘酸（performic or periodic acid）氧化之後，不
論是否事先經澱粉糖化酵素消化，以席夫（Schiff）試驗測試醛類為陽性。（Wood
and Yasutake 1955）
2.症狀：發病魚隻呈深色的色素沈著、貧血及 停止攝食，結果導致病魚生長遲緩及高死亡率。
3.解剖病變： 肝臟腫大呈淺棕色， 膽囊充滿清澈的液體，腸管呈灰白色，腸壁變薄及鬆弛， 胃排空含少量透明白色液體，鰓呈明顯的貧血，此與血液相發生相當大的改變有關，因為紅血球數及血紅素減少所致。
4.組織病變：於肝細胞內可見ceroid，ceroid色素顆粒輪廓分明，分為兩種型態，
單一的小滴（single globules）或較為濔漫性的細小的顆粒狀（finely granular），
小滴型其抗酸性及各種染色性皆較強。（Wood and Yasutake 1955）
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維他命 C缺乏症
魚類無法或僅能合成低量的維他命 C，因此極易於飼料添加不夠時缺乏。缺乏維他命C主要以兩種臨床症狀出現，一種為 骨骼系統的 變形；另一種為傷口癒合能力變差。主因維他命C是一種輔助因子(cofactor)，能水化proline成為hydroxyproline，而後者為組成膠原蛋白(collagen)的基本成分。膠原蛋白與 結締組織、骨基質、及斑痕組織形成均有密切關係。
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維他命 E缺乏症
一般而言，維他命 E的代謝與Se的代謝有關。Tocopherols是由一群相近似的化合物構成，它同時具有抗氧化及生理上的功能。本群中生物活性最高的為α-tocopherol。在含有不飽和脂肪酸的 魚類完全飼料中，通常均添加過量的維他命 E，因為它具有抗氧化的作用，因此當部分飼料氧化時，它除了能扮演抗氧化角色，尚能提供 正常生理所需的量。一般飼料均加保護型的維他命 E（α-tocopherol acetate），避免在儲藏時被氧化。維他命 E的主要功能為扮演對抗由氧化作用產生的自由基。透過提供質子給帶電的自由基，可中和自由基的毒性。通常在活組織內，維他命 E可透過含有Se的機制再度恢復活性。但是當 魚類吃到含有氧化脂肪的飼料時，此種自然維他命 E再生系統則趕不上消耗掉的維他命 E時，細胞膜會加速的耗損。在大多數動物維他命 E缺乏症狀均跟運動有關；但在 魚類有時繁殖的過程也會引發本病。
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畸形
Malformation( 畸形)之造成有先天性及後天性，於自然界中先天畸型之魚往往出生不久後，常因活力較弱容易死亡，之後魚隻會造成畸型因素仍多，如 營養素不均、外在環境、 溫度、病原感染，基因遺傳等諸多因素，但有許多畸型仍不知為何引起。
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縧蟲感染症
病原：縧蟲（Cestoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 海水（marine、brackish & freshwater）
學名：例︰
(1)廣節裂頭縧蟲（ Diphyllobothrium latum）
(2)腸舌狀縧蟲（ Ligula intestinalis）
(3)鱊頭槽縧蟲（ Bothriocephalus acheilognathi）
(4)九江頭槽縧蟲（B. gowkongensis），同義於(3)之命名
(5) 其他縧蟲（Other cestodes）
病名（及俗名）：(1)鱊頭槽縧蟲稱為亞洲魚縧蟲（Asian fish tapeworm）或錦鯉縧蟲（Koi tapeworm）
(2)腸舌狀縧蟲稱為舌狀縧蟲病（Ligulosis）
最早發現者：例︰
(1)腸舌狀縧蟲 ( L. intestinalis )；Linnaeus 1758, Gmelin, 1790.
(2)鱊頭槽縧蟲 ( B. acheilog nathi ), Yamaguti, 1934.
(3)廣節裂頭縧蟲 ( D. latum ), Linnaeus, 1758.
OIE狀況：未表列（Not Listed）
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單殖類吸虫感染症
病原：吸蟲（Trematoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine、brackish & freshwater）
學名：單殖類吸虫（monogeneans）有有數千種類主要感染養殖及野生 海水及 淡水魚體之 鰓部、 皮膚及各鰭部，有些品種可寄生兩棲龜類之 口腔與膀胱，有極少數種屬則寄生於 魚類胃腸及 體腔，如寄生於慈鯛 魚類Etroplus suratensis 胃中的腸環虫（ Enterogyrus spp.）或寄生於義大利菱 鯛科Caproidae 魚類胃中的副雙絞穴虫（ Paradiplectanotrema spp.）。另有一種單殖類感染頭足類（cephalopods， 軟體動物），另有一品種（ Oculotrema hippopotami）感染河馬（hippopotamus） 眼睛；同樣有少數屬種寄生於 淡水魚虱上的後環指虫（ Metagrodactylus spp.）；故其學名無法統一描述，以下將重要常見 海水及 淡水單殖類吸虫陳述於後。
病名（及俗名）：單殖類吸虫感染症（momgeneans infestation）
最早發現者：人類所發現第一種單殖吸虫是Muller在1770於丹麥 Hippoglossus vulgaris魚體上發現，當時以為是一種水蛭，並命名為 Hirudo hippoglossi ；直到1818年，才由Blainville訂正，命名為內吸虫（ Entobdella hippogossi）。
OIE狀況：有一種單殖類 大西洋鮭魚<三代虫（ Gyrodactylus salaris.）
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複殖類感染症
病原型別：吸蟲綱複殖吸蟲（digenean）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine、brackish & freshwater）
學名：複殖吸虫種類繁多，約有140餘科1,400多屬，萬種以上，佔吸蟲綱的大部份。本章元只能擇其重要性，並造成人畜共通的病原，作為介紹。
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耳膿腫
耳 膿瘍發生的原因是因為長期處於比平常適應 溫度低的環境中、飼養環境不良以及 營養不足而造成免疫功能的降低，繼而引起二次性感染。造成耳道 膿腫確切的病原還無法真正確定，但是維他命A缺乏的 爬蟲類據稱較容易得到耳 膿腫。
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痛風
病因：因疾病或 其他原因引起尿酸的代謝 異常， 血液中的尿酸濃度提升，形成高尿酸血症。尿酸鹽進一步在身體各部位臟器沉積，形成 痛風石。 痛風可分為原發性和次發性兩種。
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包涵體病
病因: family Retroviridae。
症狀: IBD沒有特殊的臨床症狀，任何蚺科蛇類出現 急性的 神經症狀或
是 慢性漸進性的衰弱就可懷疑是IBD的感染，特別在 蟒科。
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代謝性骨病
病因:
不均衡的 營養以及不正確的飼養管理所造成。最常見的就是長期缺鈣或維生素D3，不 正常的飲食鈣磷比(磷過高或曝曬於紫外線的時間不足。
症狀:
長骨及 下顎骨變 厚和 腫脹、長骨和 脊椎的病理性 骨折、肩胛骨水平翻轉、強直痙攣、過度反射、泄殖腔脫垂、厭食、不能走動和生長停滯。
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黴漿菌病
病因：目前在北美洲確認主要由 Mycoplasma agassizzi和 Mycoplasma testudineum感染所引起。
症狀
化 膿性鼻分泌、結膜炎、眼分泌物、眼瞼和 眼眶周圍 水腫。
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肺炎及下呼吸道感染
病因: 細菌， 病毒， 黴菌， 寄生蟲。
症狀:
陸龜的呼吸道感染症狀包括 沉鬱、 呼吸困難、伸長頸部張口呼吸、鼻分泌物(通常出現在上呼道疾病,較少出現於肺炎)、 脫水和發紺。在水龜可能在水中具肺炎的體側較重，會導致泳姿傾斜並減少待在水中的時間，蛇類 頭部可能貼著飼養箱的缸壁頂端幫助呼吸。
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殼的淺層與深層潰瘍
病因：感染、 營養不良以及 外傷為最常見的原因。通常感染的主因可以區分 細菌性與 黴菌性的兩種。偶有發生健康水龜的病例，大都與飼養的環境水質不良有關。
症狀：病患呈現衰弱，精神、食慾不佳；背甲的殼顏色呈黃 褐色，且按壓時呈鬆 軟狀，甚至可能出現 膿瘍情形。
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燙傷
病因：與飼養環境中熱源如燈泡或加熱石的距離太近、接觸過久，或因熱源 溫度過高而造成 燙傷。
症狀：會導致 皮膚淺層至深層的傷害。
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維生素A缺乏症以及維生素A過多症
維生素A缺乏症：
病因:
飲食中缺少維生素A。
症狀:
在龜類最主要的就是眼瞼 水腫，伴隨有黃 白色細胞殘餘物在眼瞼底下，可能一眼或是兩眼。
其他可能會出現厭食、昏睡、體重下降和鼻或眼有分泌物。
箱龜會有耳朵、呼吸道的感染以及卵滯留。年幼海龜眼瞼會過度角化。腹股溝和腋窩 水腫顯示出伴隨有 腎衰竭及預後不佳。
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腎病
病原型別： 營養性
人畜共通：No
腎病的臨床表現通常不明顯，無法單憑動物的臨床表徵來推斷。首先病史是很重要的，了解動物的飼養狀況，包括 食物種類，飼養環境 溫度、 光照等，其次是物理學檢查。體溫、體重、 脫水程度的評估以及觸診是基本的，此外獸醫師通常必須借助 血液學、血清生化檢查、尿液分析、X光造影或 腎臟組織生檢切片檢查法以明確的診斷。
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