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偽單胞菌感染症
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名： Pseudomonas fluorescens及 Pseudomonas anguilliseptica.
病名(及俗名)： 偽單胞菌敗血症Pseudomonad septicaemia ( P. fluorescens)，紅點病（赤點病）red spot disease 或 red pest ( P. anguilliseptica)。
最早發現者：Plehn (1924) 在鯉魚發現P. fluorescens。Wakabayashi (1972)在日本鰻發現P. anguilliseptica。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
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嘉魶虹彩病毒病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水學名：Red sea bream iridovirus (RSIV)
病名(及俗名)：RSIV
最早發現者： Inouye 等(1992)發現RSIV。 He等（2001）發現ISKNV。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
本病（Red sea bream iridoviral disease）由兩個病原引起：嘉魶虹彩病毒（Red sea bream iridovirus及傳染性脾臟與腎臟壞死病毒（infectious spleen and kidney necrosis virus , ISKNV）。
人畜共通：非人畜共通。
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鯉魚春季毒血症
病原型別：病毒
病原環境：淡水
學名：Spring viremia of carp virus
病名(及俗名)：SVC, Rhabdovirus carpio
最早發現者：Fijan et al. (1971)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本病毒暫時分類於棒狀病毒科(Rhabdoviridae)，疱病毒屬(Vesiculovirus)。由單鏈、負股核醣核酸組成。基因組包含11019個核苷酸，可轉譯出5個結構蛋白質：核蛋白（nucleoprotein, N）、磷蛋白（phosphoprotein, P）、基質蛋白（matrix protein, M）、醣蛋白（glycoprotein, G）及核醣核酸相關聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, L）。 五個結構蛋白質在基因組上排列順序為3’-N-P-M-G-L- 5’。
P及N蛋白與病毒的基因組相接合，與病毒的轉錄及複製有關
G蛋白在病毒表面形成三聚體包膜突起，與細胞上的接受體結合可引起胞吞作用。G蛋白同時具有可引起魚類中和抗體的抗原決定位 。L蛋白為核醣核酸聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase) ，與複製有關 。
魚類棒狀病毒（piscine rhabdovirus）分為四個基因型。第一基因型（SVCV）、第二基因型（grass carp rhabdovirus）、第三基因型（pike fry rhabdovirus） 及第四基因型（tench rhabdovirus）。 第一基因型 (SVCV) 又細分為四個基因亞型：Ia基因型病毒(亞洲)、Ib及Ic基因型病毒(摩爾達維亞Moldova，烏克蘭及蘇俄)，Id基因型病毒(英國，前蘇聯) 。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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梨形四膜蟲症
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水
學名： Tetrahymena corlissi、Tet. pyriformis、Tet. faurei、Tet. rostrata
病名(及俗名)：Tetrahymena infection、TET disease、Guppy disease
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
橢圓梨形小纖毛蟲(30-60 x 50-100 μm)，放射狀、對稱的體形，表面佈滿20-30排的纖毛縱列(Kinety)。 口腔內具有特殊的纖毛口器(oral ciliary apparatus)， 口腔右側具有側口膜(paraoral membrane)，三個連續排列的膜則位於左側。 口腔的底部為進食開口處(cytostome)。 口腔的後緣有一至三排纖毛縱列。繁殖採用二分裂法；但有些會產生生殖囊泡，內含二至八個幼蟲(tomite)。大部分對魚而言是機緣性寄生；少部分則為絕對寄生，引起魚類致死的寄生蟲。
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鮭弧菌
1.病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 海水
學名： Vibrio salmonicida
病名(及俗名)：冷水弧菌病（coldwater vibriosis）或Hitra disease
最早發現者：Egidius et al.1981
OIE狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性彎曲短桿菌，大小1.2～2.6×0.5μm，具運動性、極鞭毛、不形成孢子、兼性厭氧，oxidase及catalase反應陽性，但不具產生citrate、H 2S、urease、indole、arginine dihydrolase、gelatin、lysine decarboxylase、ornithine decarboxylase、β-galactosidase和voges-proskauer的能力。本菌具嗜鹽性及嗜冷性，在含0～4％(w/v)氯化鈉的條件下可生長，而於含7％(w/v)氯化鈉的條件下無法生長，另可在低於1℃的溫度下生長，最適合的生長溫度為15℃左右，而無法在37℃生長。對vibriostatic agent O/129敏感，但對 novobiocin 不敏感，可在海水中存活超過14個月[3,6]。
人畜共通：否
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台灣異形吸虫症
病原型別：吸虫（Trematodes）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine, brackish ＆ freshwater）
學名： Centrocestus formosanus
病名（及俗名）：台灣異形吸虫症（ Centrocestus formosanus infection），異形吸虫症（Heterophylosis、Centrocestiasis）
最早發現者：Nishigori et al.（1924）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
本吸虫體之大小為0.36mm×0.179mm，前後兩列頭棘，大小不等各有16支，共有32支，子宮內卵子數約10至20個左右，卵殼外表呈格子狀斑紋，寄生於終宿主之小腸特別是十二指腸，而第二中間宿主為 淡水魚類，以其 鰓絲為主要危害器官。
人畜共通：目前異形科（Heterophyidae）內的吸虫，感染人體的報告共有5種，包括台灣異型吸虫（ Centrocestus formosanus Nishigori, 1924）
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錦鯉疱疹病毒
1.病原概述：
病原型別： 病毒(virus)
病原環境： 淡水
學名：
病名(及俗名)： koi herpesvirus disease (KHVD)
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
病毒之genome 大小約150Kbp到277-295Kbp 之間(Ishioka et al 2005)至少已有4個基因已被研究分別為 helicase、intercapsomeric triplex protein, DNA polymerase, 及 major capsid protein。基因上與 CyHV-1 及 CyHV-2 相近，但與, channel catfish virus virus ( Ictalurid herpesvirus: IcHV-1) 則較不相似。 病毒為二十面體、大小約80-120nm之間，具有被膜(envelope)( Perelberg et al 2003)。於血清學研究KHV 與CyHV-1 具有交叉反應(OIE 2006)。
人畜共通：No
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腸炎弧菌
病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 半鹹水， 海水、沈積物、海洋動物體表。
學名： Vibrio paraheamolyticus
病名(及俗名)：腸炎弧菌
最早發現者：Sakazaki（1963）
ＯＩＥ狀況：未表列(Not Listed)
病原摘要：弧菌屬革蘭氏陰性彎曲短桿菌，可運動、具極鞭毛、不形成孢子、在端鞭毛無法作用下會於體側產生許多無鞘之側鞭毛，兼性厭氧、為 oxidase 反應陽性、嗜鹽性，環境中 NaCl 之含量低於 0.5 % 或高於 10% 均不能生長，對酸敏感但有耐鹼性，因此可在alkaline peptone water中培養，最適合之鹽濃度為 2-3 %，最適生長溫度為 37℃[5]。
人畜共通：是
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單殖類吸虫感染症
病原：吸蟲（Trematoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine、brackish & freshwater）
學名：單殖類吸虫（monogeneans）有有數千種類主要感染養殖及野生 海水及 淡水魚體之 鰓部、 皮膚及各鰭部，有些品種可寄生兩棲龜類之 口腔與膀胱，有極少數種屬則寄生於 魚類胃腸及 體腔，如寄生於慈鯛 魚類Etroplus suratensis 胃中的腸環虫（ Enterogyrus spp.）或寄生於義大利菱 鯛科Caproidae 魚類胃中的副雙絞穴虫（ Paradiplectanotrema spp.）。另有一種單殖類感染頭足類（cephalopods， 軟體動物），另有一品種（ Oculotrema hippopotami）感染河馬（hippopotamus） 眼睛；同樣有少數屬種寄生於 淡水魚虱上的後環指虫（ Metagrodactylus spp.）；故其學名無法統一描述，以下將重要常見 海水及 淡水單殖類吸虫陳述於後。
病名（及俗名）：單殖類吸虫感染症（momgeneans infestation）
最早發現者：人類所發現第一種單殖吸虫是Muller在1770於丹麥 Hippoglossus vulgaris魚體上發現，當時以為是一種水蛭，並命名為 Hirudo hippoglossi ；直到1818年，才由Blainville訂正，命名為內吸虫（ Entobdella hippogossi）。
OIE狀況：有一種單殖類 大西洋鮭魚<三代虫（ Gyrodactylus salaris.）
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膿疱症
形成 膿疱的原因多元，感染性的病原如 細菌、 黴菌、 寄生蟲及包埋於組織間的異物，這些病原或異物若未清除，會造成滲出液的堆積，堆積的滲出液則會刺激 纖維素性<的外鞘生成，最後堅硬的纖維性的外壁會包覆整個 膿疱。在 爬蟲類提供外源性病原入侵的通道包括 皮膚、消化道、或肺，一旦病原進入體內，便可藉由血行擴散至任何器官。
健康的 爬蟲類可以抵抗輕微的感染而無明顯的長期副作用，但在體質不佳的 爬蟲類則會造成危害，不良的飼養管理尤其是個指標。
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耳膿腫
耳 膿瘍發生的原因是因為長期處於比平常適應 溫度低的環境中、飼養環境不良以及 營養不足而造成免疫功能的降低，繼而引起二次性感染。造成耳道 膿腫確切的病原還無法真正確定，但是維他命A缺乏的 爬蟲類據稱較容易得到耳 膿腫。
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泄殖腔脫垂
主要是由於刺激性的原因造成器官及 肌肉過度用力，像是腸炎、膀胱 結石和 便秘而發生； 神經功能不足；陰莖或 半陰莖會因感染、以探針判別性別時、以及在交配時強行分開而脫出；雌性 輸卵管會因卵滯症及造成裡急後重的原因而脫出；膀胱會因為膀胱炎或 結石而脫出；結腸主要是因為裡急後重的用力、便祕、 細菌性及 寄生蟲性的腸炎而造成。
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隱孢子蟲症
病因：隱孢子蟲(Cryptosporidium.spp)感染，確認可感染的爬蟲的為 Cryptosporidium.serpentis
症狀：食慾精神低下及厭食，蛇類在進食後持續或週期性的發生 嘔吐或反逆症狀，可能嘔出未消化的食物。
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代謝性骨病
病因:
不均衡的 營養以及不正確的飼養管理所造成。最常見的就是長期缺鈣或維生素D3，不 正常的飲食鈣磷比(磷過高或曝曬於紫外線的時間不足。
症狀:
長骨及 下顎骨變 厚和 腫脹、長骨和 脊椎的病理性 骨折、肩胛骨水平翻轉、強直痙攣、過度反射、泄殖腔脫垂、厭食、不能走動和生長停滯。
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蛇副黏液病毒
病因：Ophidian paramyxovirus (OPMV)
family paramyxoviridae.
症狀：副黏液 病毒感染沒有病源特有的臨床症狀，此疾病主要影響呼吸系統，但出現的症狀變化相當大，因此在臨床上診斷相當困難。
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兩爬類的尾部傷害
病因: 造成尾部 缺損的原因包括先天性缺陷，物理性創傷，感染性疾病，代謝性疾病及自割行為。
症狀: 兩爬類的尾巴有社交信號，平衡，游泳等功能，尾部 缺損可能影響身體部分 正常動作的執行甚至尾部 癱瘓。
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燙傷
病因：與飼養環境中熱源如燈泡或加熱石的距離太近、接觸過久，或因熱源 溫度過高而造成 燙傷。
症狀：會導致 皮膚淺層至深層的傷害。
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蜥蜴的胃腸道疾病
病因：
病毒性
里奧 病毒(Reovirus)
腺 病毒(Adenovirus)，在肥尾 守宮"> 守宮有報告
細菌性
沙門氏桿菌
大腸桿菌
其他菌種
黴菌性
黴菌性腸炎(尤其在 變色龍常見)
酵母菌(yeast)感染，有些病例可能和長期投與抗生素有關
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蜥蜴的骨骼肌肉系統疾病
病因：
細菌性
敗血性關節炎
骨髓炎
蜂窩性組織炎
肌肉炎
黴菌性
寄生蟲性
嚴重 寄生蟲感染，特別是 血液寄生蟲( 貧血)或是 胃腸道 寄生蟲(原蟲類或是蠕蟲類)
營養性
代謝性骨病(MBD)
營養性繼發性副 甲狀腺亢進(飲食中鈣質缺乏、飲食中鈣磷比不均衡、維生素D3不足[缺乏紫外線照射或飲食中維生素D3攝取不足])
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