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對蝦桿狀病毒症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名： Baculovirus penaei
病名(及俗名)：
最早發現者：最早由Couch(1974)、Summer(1977)發現。
OIE狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
目前暫定於 Nucleopolyherdovirus屬。至少存在來至三個不同地域的 病毒株，(1) 美國大西洋東南海域及墨西哥沿岸及加勒比海(2)南、中及北美洲(3)夏威夷。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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線蟲感染症
1.病原概述
病原型別：寄生蟲
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：可參考Anderson’s system (Anderson RC, 2000)
病名(及俗名)：主要依感染種類及部位命名
最早發現者：歐洲淡水魚線蟲參考(Avdeev et al, 1987; Moravec 1994)；北美參考( Hoffman, 1999)；新熱帶區 (Moravec, 1998)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
雌雄異體，大多數為卵生，少數為胎生。仔蟲須先被中間宿主（甲殼類）吞食，中間宿主再被魚類#(B01)#吞食才能完成寄生。若魚類為終宿主則在此完成生活史。若魚類僅為中間宿主，則僅被包被在魚體，必須再被其終宿主（鳥類、人類或另一種魚類）吞食才能完成生活史。所有魚種均會感染；宿主主要依線蟲的終宿主及中間宿主而定。具有特定宿主的線蟲(例如 Skrjabillanid genera)通常僅能感染某棲息地的魚種；具有廣泛宿主的線蟲(例如 Capillaria sp.)則可感染世界上許多地區的魚種。
人畜共通：有些寄生蟲，例如海獸胃線蟲( Anisakis)及Pseudo -terranova仔蟲會造成人畜共通傳染病。
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壞死性肝胰腺炎
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：壞死性肝胰腺炎細菌NHP bacterium (NHPB)
病名(及俗名)：壞死性肝胰腺炎、德州蝦池死亡症候群 Texas Pond Mortality Syndrome (TPMS)、 祕魯壞死性肝胰腺炎 Peru necrotizing hepatopancreatitis( PNHP)
最早發現者：最早由Frelier等 (1992)在美國德州太平洋白蝦養殖場發現。
OIE狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
壞死性肝胰腺炎細菌為葛蘭氏陰性染色、多形性、胞內寄生的立克次體樣細菌，分散在於感染的肝胰腺細胞胞質內。本菌主要的型態為桿狀立克次體樣細菌 (0.25 x 0.9 um)，偶而以基底端含有八條鞭毛，頂端有一至二條鞭毛的螺旋體(0.25 x 2-3.5 um)出現。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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牡蠣奴卡氏菌症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 海水
學名： Nocardia crassostreae
病名(及俗名)：
Nocardiosis, Fatal inflammatory bacteraemia (FIB), Focal necrosis, Multiple abscesses, Summer mortality, Pacific oyster nocardiosis (PON).
最早發現者：最早由Friedman等 (1987)分離本菌。
OIE狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
本菌 Nocardia crassostreae會引起太平洋牡蠣 Pacific oysters, Crassostrea gigas局部或全身疾病。本菌為好氣性生長、弱抗酸染色,、產生會分枝的不規則菌絲體； 肽聚醣 (peptidoglycan)含有meso-diaminopimelic acid ，利用arabinose 及 galactose 為主要醣源，46-58個碳原子組成的分枝菌酸、及G+C-rich 的核酸。依據部分165 rRNA gene序列分析，發現應該歸屬在 Nocardia otitidiscaviarum rRNA sub-group 下。本菌的標準株為NB4H (= ATCC 700418)。
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水黴菌感染症
病原型別：黴菌
病原環境：淡水及淡鹹水
學名： Achlya屬 及 Saprolegnia屬
病名(及俗名)：Typical water mold infection，Saprolegniosis，Oomycete infection
最早發現者：最早由Tiffeney (1939) 發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
水黴菌是目前淡水及淡鹹水魚最常見的黴菌病原。主要病原來自卵菌綱(Class Oomycetes)、水黴菌目 ( Saprolegniales)、水黴菌科( Saprolegniaceae)下的綿黴菌屬( Achlya)及水黴菌屬( Saprolegnia)兩屬。水黴主要是一種利用腐敗有機質為食物的機緣性腐生病原。最常分離到的水黴菌為： Saprolegnia parasitica及 S. diclina。
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鰻魚凹凸病
1.病原概述
病原型別：寄生蟲
病原環境：淡水、淡鹹水及鹹水
學名：Pleistophora anguillarum
病名(及俗名)：Beko Disease
最早發現者： Hoshina(1951).在日本鰻發現本症。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：本孢子為長卵圓形，後部有個佔全長2/3長度的空泡。孢子大小為2.4 um x 7.8 um。
病原分類：
微孢子門 (Microspora)、微孢子目(Microsporida)、Pansporoblastina亞目、Pleistophora屬、anguillarum種。
別名：Plistophora anguillarum ，Heterosporis anguillarum
命名沿革：最早命名為Pleistophora anguillarum (1959)，後來Lom等(2000)依據超顯微結構建議改歸類於另一屬Heterosporis。
疾病特性：
（感染組織及器官：感染路徑、好發組織器官、宿主）
目前證實水平感染，主要感染日本鰻。人工感染，其感受性依次為鱸鰻（Anguilla mormorata）、日本鰻（Anguilla japonica）、美洲鰻（Anguilla rostrata）。本症主要感染橫紋肌。體液免疫方面，感染凹凸病原蟲後之日本鰻線在第 6週才有較明顯的抗體陽性
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氨中毒
1.病因：Ammonia污染水路、池水及湖泊，可能經由有機及無機二種來源，有機的途徑包括：公眾的污水系統、局部及大規模的農業污染，水中 硝酸鹽及 亞硝酸鹽等的生物化學還原作用；而無機的途徑則包含：氣體工廠及植物煉碳廠及發電廠等之工業廢水。
在水中ammonia是以未解離氨（NH3）及解離氨（NH4+）兩種形式存在，其比例與 水溫及 PH值有很大的關聯，其毒性的作用因NH3非常容易通過組織的障壁，所以對魚的毒性很高，又氨對 腦有特別的親和性
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硫化氫中毒
硫化氫為具臭味的強毒性氣體，在自然的情況下，底泥的有機物質或被有機污染的水體中之蛋白質，經過厭氧性細菌分解產生硫化氫（H 2S），硫化氫在水中會解離成HS-及S 2-，其毒性依序為H 2S> HS ->S 2-，當水中的 PH值增加時，硫化氫的毒性會降低，因為未解離的強毒性的H2S變成毒性較低的HS-離子，在PH9時幾乎99%之硫化物以HS -的形式存在，PH7時HS -與H 2S以1：1的比例存在，但在PH5則幾乎99%為H 2S。（謝介士，1994）
硫化氫對魚類有很強的毒性，不同的魚種，其致死濃度範圍從0.4 mg/L（鮭鱒類）到4mg/L（歐洲 鯽魚、丁鱖及鰻魚）不等（Svobodová, 1991）。已有許多文獻報告，研究硫化氫對不同魚種的毒性作用。當藍鰓太陽魚曝露在0.04 mg/L 的H 2S下，其游泳的耐受力降低；即使H 2S的濃度在非常低的情況下，亦會傷害魚卵
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有機磷中毒
殺蟲劑的使用愈來愈多，不論是總量或範圍，目前殺蟲劑已經是魚類中毒的重要原因之一。養殖魚池常因水源為農田沖刷水或工業廢水，而受殺蟲劑污染，或因為養殖池為消除水中的植物和藻類使用除草劑及除藻劑，而造成水體的污染，導致對魚隻健康的危害。
殺蟲劑污染對養殖魚的影響，在低濃度的情況下，直接作用於魚體，其危害為長期且持續的，會傷害 魚苗早期的發育；間接的影響則是水中的浮游生物及水生植物死亡，腐敗分解需要消耗大量的氧氣，導致氧缺乏使魚隻窒息；另一個非常嚴重的間接影響是，以藻類及浮游生物為食物的魚隻，水體遭受殺蟲劑污染，結果造成魚隻天然的食物基礎徹底的破壞，許多微生物對有機磷殺蟲劑比魚本身還敏感，例如Soldep之LC 50在 鯉魚為545 mg/L，而對Daphnia magna 的LC 50只要0.0002-0.001 mg/L的濃度。
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黃麴毒素中毒
黃麴毒素中毒是由於動物對於黴菌中的黃麴菌屬 、Aspergillus parasiticus等之代謝產物的毒力作用具有感受性的一種疾病，這些黴菌在含的油質的植物上生長得最好；黃麴毒素的產生與黴菌生長一樣，受到飼料保存場所的一些環境因素影響（濕度、溫度及其他）；黃麴毒素為高耐熱性，可抵擋300℃的高溫，黃麴毒素有好幾種，其中以aflatoxin B1毒性最強。
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櫻鱒病毒病
1.病原概述
病原型別：病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：Oncorhynchus masou virus
病名(及俗名)： Oncorhynchus masou virus disease, OMVD, OMV
最早發現者：最早由Kimura 等(1981)發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
本病毒一般稱為 Oncorhynchus masou virus (OMV)，目前暫定於 Herpesviridae科。本病毒為具有封套、20面體、大小120-200 nm、 dsDNA病毒。本病毒抗原性與出現在美國西岸的herpesvirus of Salmonidae type 1(SalHV-1)不同。暫定為 Salmonid herpesvirus 2; SalHV-2。
人畜共通：否
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魚類立克次體症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡水及海水
學名： Piscirickettsia salmonis
病名(及俗名)：Salmonid rickettsial septicemia (SRS), Coho salmon syndrome
最早發現者： Bravo等(1989).在智利發現本症，Fryer 等(1990, 1992)分離及正式命名。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：革蘭氏陰性、營養需求高、絕對魚類細胞質內生長的細菌。親緣關係上，它與Coxiella 及 Francisella 有些微親緣關係。.
命名沿革：最早由Fryer 等(1992) 命名 。
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偽單胞菌感染症
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名： Pseudomonas fluorescens及 Pseudomonas anguilliseptica.
病名(及俗名)： 偽單胞菌敗血症Pseudomonad septicaemia ( P. fluorescens)，紅點病（赤點病）red spot disease 或 red pest ( P. anguilliseptica)。
最早發現者：Plehn (1924) 在鯉魚發現P. fluorescens。Wakabayashi (1972)在日本鰻發現P. anguilliseptica。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
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嘉魶虹彩病毒病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水學名：Red sea bream iridovirus (RSIV)
病名(及俗名)：RSIV
最早發現者： Inouye 等(1992)發現RSIV。 He等（2001）發現ISKNV。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
本病（Red sea bream iridoviral disease）由兩個病原引起：嘉魶虹彩病毒（Red sea bream iridovirus及傳染性脾臟與腎臟壞死病毒（infectious spleen and kidney necrosis virus , ISKNV）。
人畜共通：非人畜共通。
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殼病
病原型別： 細菌
病原環境： 海水
學名：
病名(及俗名)：Chitinolytic bacterial disease, Epizootic shell disease.
最早發現者：Malloy等(1978) 在 龍蝦發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
基丁質溶解革蘭氏陰性細菌及偽單孢菌( Pseudomonas), 弧菌( Vibrio) 及產黃桿菌科 ( Flavobacteriaceae)的細菌均被分離過。
人畜共通：否
2.病原分類
Pseudomonadaceae, Vibrionaceae, Flavobacteriaceae科， Cytophaga-，
Flavobacter 及 Alpha proteobacteria groups；Oceanobacillus，Staphylococcus屬.。
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種蝦分離之致死病毒症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：Spawner-isolated mortality virus
病名(及俗名)：Spawner-isolated mortality virus disease, SMVD, SM
最早發現者：澳洲Fraser & Owen (1996) 在草蝦發現。Albaladejo 等（1998）在菲律賓草蝦亦有相同發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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鯉魚春季毒血症
病原型別：病毒
病原環境：淡水
學名：Spring viremia of carp virus
病名(及俗名)：SVC, Rhabdovirus carpio
最早發現者：Fijan et al. (1971)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本病毒暫時分類於棒狀病毒科(Rhabdoviridae)，疱病毒屬(Vesiculovirus)。由單鏈、負股核醣核酸組成。基因組包含11019個核苷酸，可轉譯出5個結構蛋白質：核蛋白（nucleoprotein, N）、磷蛋白（phosphoprotein, P）、基質蛋白（matrix protein, M）、醣蛋白（glycoprotein, G）及核醣核酸相關聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, L）。 五個結構蛋白質在基因組上排列順序為3’-N-P-M-G-L- 5’。
P及N蛋白與病毒的基因組相接合，與病毒的轉錄及複製有關
G蛋白在病毒表面形成三聚體包膜突起，與細胞上的接受體結合可引起胞吞作用。G蛋白同時具有可引起魚類中和抗體的抗原決定位 。L蛋白為核醣核酸聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase) ，與複製有關 。
魚類棒狀病毒（piscine rhabdovirus）分為四個基因型。第一基因型（SVCV）、第二基因型（grass carp rhabdovirus）、第三基因型（pike fry rhabdovirus） 及第四基因型（tench rhabdovirus）。 第一基因型 (SVCV) 又細分為四個基因亞型：Ia基因型病毒(亞洲)、Ib及Ic基因型病毒(摩爾達維亞Moldova，烏克蘭及蘇俄)，Id基因型病毒(英國，前蘇聯) 。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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梨形四膜蟲症
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水
學名： Tetrahymena corlissi、Tet. pyriformis、Tet. faurei、Tet. rostrata
病名(及俗名)：Tetrahymena infection、TET disease、Guppy disease
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
橢圓梨形小纖毛蟲(30-60 x 50-100 μm)，放射狀、對稱的體形，表面佈滿20-30排的纖毛縱列(Kinety)。 口腔內具有特殊的纖毛口器(oral ciliary apparatus)， 口腔右側具有側口膜(paraoral membrane)，三個連續排列的膜則位於左側。 口腔的底部為進食開口處(cytostome)。 口腔的後緣有一至三排纖毛縱列。繁殖採用二分裂法；但有些會產生生殖囊泡，內含二至八個幼蟲(tomite)。大部分對魚而言是機緣性寄生；少部分則為絕對寄生，引起魚類致死的寄生蟲。
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車輪蟲症
1.病原概述
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水及 海水
學名： Trichodina spp., Trichodinella spp.
病名(及俗名)：
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
車輪蟲科(Trichodinidae)內分七屬：Trichodina，Hemitrichodina，Vachomia，Paratrichodina，Tripartiella，Trichodinella，Dipartiella。型態大致相似，引起的病都叫做「車輪蟲症」。外表像一車輪，中央具有車軸。以週緣的纖毛運動。一般而言，大於90 um，寄生 皮膚者，有較多的寄生宿主；小於30 um寄生 鰓者，寄生較少的魚種。病原若離開魚體約可存活1到2天。
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套拉症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：Taura syndrome virus
病名(及俗名)：套拉症
最早發現者：最早由Bonami(1997)、Mari (2002)發現。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本 病毒目前暫定在Dicistroviridae科。 病毒顆粒為 32 nm，不含封套、二十面體、、浮力密度為1.338 g/ml。基因組為線狀、正端單股RNA 病毒，由10205個核苷酸組成。不具有3’ poly-A 尾巴。基因組包含兩個大的開放讀取區(ORF)；ORF 1 包括非結構蛋白，ORF 2包括結構蛋白，三個主要核衣蛋白為 VP1, VP2, VP3 (55, 40及24 kDa)。 病毒在細胞質內複製。
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