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線蟲感染症
1.病原概述
病原型別：寄生蟲
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：可參考Anderson’s system (Anderson RC, 2000)
病名(及俗名)：主要依感染種類及部位命名
最早發現者：歐洲淡水魚線蟲參考(Avdeev et al, 1987; Moravec 1994)；北美參考( Hoffman, 1999)；新熱帶區 (Moravec, 1998)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
雌雄異體，大多數為卵生，少數為胎生。仔蟲須先被中間宿主（甲殼類）吞食，中間宿主再被魚類#(B01)#吞食才能完成寄生。若魚類為終宿主則在此完成生活史。若魚類僅為中間宿主，則僅被包被在魚體，必須再被其終宿主（鳥類、人類或另一種魚類）吞食才能完成生活史。所有魚種均會感染；宿主主要依線蟲的終宿主及中間宿主而定。具有特定宿主的線蟲(例如 Skrjabillanid genera)通常僅能感染某棲息地的魚種；具有廣泛宿主的線蟲(例如 Capillaria sp.)則可感染世界上許多地區的魚種。
人畜共通：有些寄生蟲，例如海獸胃線蟲( Anisakis)及Pseudo -terranova仔蟲會造成人畜共通傳染病。
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牡蠣奴卡氏菌症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 海水
學名： Nocardia crassostreae
病名(及俗名)：
Nocardiosis, Fatal inflammatory bacteraemia (FIB), Focal necrosis, Multiple abscesses, Summer mortality, Pacific oyster nocardiosis (PON).
最早發現者：最早由Friedman等 (1987)分離本菌。
OIE狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
本菌 Nocardia crassostreae會引起太平洋牡蠣 Pacific oysters, Crassostrea gigas局部或全身疾病。本菌為好氣性生長、弱抗酸染色,、產生會分枝的不規則菌絲體； 肽聚醣 (peptidoglycan)含有meso-diaminopimelic acid ，利用arabinose 及 galactose 為主要醣源，46-58個碳原子組成的分枝菌酸、及G+C-rich 的核酸。依據部分165 rRNA gene序列分析，發現應該歸屬在 Nocardia otitidiscaviarum rRNA sub-group 下。本菌的標準株為NB4H (= ATCC 700418)。
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水黴菌感染症
病原型別：黴菌
病原環境：淡水及淡鹹水
學名： Achlya屬 及 Saprolegnia屬
病名(及俗名)：Typical water mold infection，Saprolegniosis，Oomycete infection
最早發現者：最早由Tiffeney (1939) 發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
水黴菌是目前淡水及淡鹹水魚最常見的黴菌病原。主要病原來自卵菌綱(Class Oomycetes)、水黴菌目 ( Saprolegniales)、水黴菌科( Saprolegniaceae)下的綿黴菌屬( Achlya)及水黴菌屬( Saprolegnia)兩屬。水黴主要是一種利用腐敗有機質為食物的機緣性腐生病原。最常分離到的水黴菌為： Saprolegnia parasitica及 S. diclina。
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氨中毒
1.病因：Ammonia污染水路、池水及湖泊，可能經由有機及無機二種來源，有機的途徑包括：公眾的污水系統、局部及大規模的農業污染，水中 硝酸鹽及 亞硝酸鹽等的生物化學還原作用；而無機的途徑則包含：氣體工廠及植物煉碳廠及發電廠等之工業廢水。
在水中ammonia是以未解離氨（NH3）及解離氨（NH4+）兩種形式存在，其比例與 水溫及 PH值有很大的關聯，其毒性的作用因NH3非常容易通過組織的障壁，所以對魚的毒性很高，又氨對 腦有特別的親和性
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亞硝酸中毒
亞硝酸通常伴隨著 硝酸及氨氮存在於水的表面，不過他們的濃度一般都很低，因為他們極不穩定，很容易氧化還原，最後分解為有機氮化合物，所以在水面及土壤中幾乎没有 亞硝酸，會造成污染，大多由於農場使用含氮的肥料或糞肥，沖刷到水體所致。（Svobodová, 1991）
另外在 淡水養殖場，亞硝酸中毒很容易發生在新建立的養殖系統，稱為新池症候群（New Tank Symdrome），因為新的養殖池中硝化細菌（Nitrobacter）尚未建立，養殖密度過高或過飼
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硫化氫中毒
硫化氫為具臭味的強毒性氣體，在自然的情況下，底泥的有機物質或被有機污染的水體中之蛋白質，經過厭氧性細菌分解產生硫化氫（H 2S），硫化氫在水中會解離成HS-及S 2-，其毒性依序為H 2S> HS ->S 2-，當水中的 PH值增加時，硫化氫的毒性會降低，因為未解離的強毒性的H2S變成毒性較低的HS-離子，在PH9時幾乎99%之硫化物以HS -的形式存在，PH7時HS -與H 2S以1：1的比例存在，但在PH5則幾乎99%為H 2S。（謝介士，1994）
硫化氫對魚類有很強的毒性，不同的魚種，其致死濃度範圍從0.4 mg/L（鮭鱒類）到4mg/L（歐洲 鯽魚、丁鱖及鰻魚）不等（Svobodová, 1991）。已有許多文獻報告，研究硫化氫對不同魚種的毒性作用。當藍鰓太陽魚曝露在0.04 mg/L 的H 2S下，其游泳的耐受力降低；即使H 2S的濃度在非常低的情況下，亦會傷害魚卵
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魚類立克次體症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡水及海水
學名： Piscirickettsia salmonis
病名(及俗名)：Salmonid rickettsial septicemia (SRS), Coho salmon syndrome
最早發現者： Bravo等(1989).在智利發現本症，Fryer 等(1990, 1992)分離及正式命名。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：革蘭氏陰性、營養需求高、絕對魚類細胞質內生長的細菌。親緣關係上，它與Coxiella 及 Francisella 有些微親緣關係。.
命名沿革：最早由Fryer 等(1992) 命名 。
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嘉魶虹彩病毒病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水學名：Red sea bream iridovirus (RSIV)
病名(及俗名)：RSIV
最早發現者： Inouye 等(1992)發現RSIV。 He等（2001）發現ISKNV。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
本病（Red sea bream iridoviral disease）由兩個病原引起：嘉魶虹彩病毒（Red sea bream iridovirus及傳染性脾臟與腎臟壞死病毒（infectious spleen and kidney necrosis virus , ISKNV）。
人畜共通：非人畜共通。
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鯉魚春季毒血症
病原型別：病毒
病原環境：淡水
學名：Spring viremia of carp virus
病名(及俗名)：SVC, Rhabdovirus carpio
最早發現者：Fijan et al. (1971)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本病毒暫時分類於棒狀病毒科(Rhabdoviridae)，疱病毒屬(Vesiculovirus)。由單鏈、負股核醣核酸組成。基因組包含11019個核苷酸，可轉譯出5個結構蛋白質：核蛋白（nucleoprotein, N）、磷蛋白（phosphoprotein, P）、基質蛋白（matrix protein, M）、醣蛋白（glycoprotein, G）及核醣核酸相關聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, L）。 五個結構蛋白質在基因組上排列順序為3’-N-P-M-G-L- 5’。
P及N蛋白與病毒的基因組相接合，與病毒的轉錄及複製有關
G蛋白在病毒表面形成三聚體包膜突起，與細胞上的接受體結合可引起胞吞作用。G蛋白同時具有可引起魚類中和抗體的抗原決定位 。L蛋白為核醣核酸聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase) ，與複製有關 。
魚類棒狀病毒（piscine rhabdovirus）分為四個基因型。第一基因型（SVCV）、第二基因型（grass carp rhabdovirus）、第三基因型（pike fry rhabdovirus） 及第四基因型（tench rhabdovirus）。 第一基因型 (SVCV) 又細分為四個基因亞型：Ia基因型病毒(亞洲)、Ib及Ic基因型病毒(摩爾達維亞Moldova，烏克蘭及蘇俄)，Id基因型病毒(英國，前蘇聯) 。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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細菌性鰓病
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水
學名： Flavobacterium branchiophilum
病名(及俗名)：Bacterial gill disease (BGD)
最早發現者：Davis (1926)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not Listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性桿菌，型態彎曲，長度1μm ~5μm，菌落通常呈橘 黃色，其生化特性oxidase試驗為陰性, phosphatase試驗為陰性而ribonuclease試驗則為陽性。
人畜共通：非人畜共通
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河鯰病毒病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水
學 名： Ictalurid herpesvirus 1
病名(及俗名)：Channel catfish virus disease
最早發現者：發現於1968年 病毒確認於1971年
OIE狀況：未表列(Not Listed)
河鯰 病毒病為一病程迅速且具高度傳染性的 病毒性疾病，發生於養殖的幼年河鯰。
本病非人畜共通傳染病
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卵圓鞭毛蟲
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 半鹹水、 海水
學名： Amyloodinium ocellatum
病名(及俗名)：卵圓鞭毛蟲感染症(Amyloodiniasis)、絲絨病(Velvet disease)、銹病(Rust disease)、金粉症(Gold rust disease)
最早發現者：Brown, (1931)
ＯＩＥ狀況：非表列(Not Listed)
病原摘要：
卵圓鞭毛蟲 營養體以碟狀構造吸附於宿主，此碟狀構造具有一非常短的柄，且於吸盤的周圍有一圈 絲狀的假根可深入宿主的上皮細胞，ㄧ觸手狀的構造自細胞基底部延伸出，其功能尚未明瞭，細胞質缺乏葉綠粒但具有消化食泡及澱粉顆粒和多種特殊胞器， 營養體呈梨狀或卵圓狀，體長約150~350 um。
人畜共通：非人畜共通
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心形蟲
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水
學名： Chilodonella hexasticha
病名(及俗名)：Chilodonellosis, Chilodonelliasis, Warmwater Chilodonelliasis
最早發現者：(Kiernik, 1909) Kahl, 1931
ＯＩＥ狀況：非表列(Not listed)
病原摘要：
蟲體呈扁平狀，後緣具缺痕，背側成圓凸狀，腹側則為平坦狀，腹側的纖毛呈兩群，右側的纖毛群成拱狀且較左側長，由5-7個動基體(kineties)所構成，而左側的纖毛由7-9個動基體組成且較筆直。 具可伸縮口器，其構造明顯且位於腹側，具有ㄧ個大核位於背側接近蟲體的末端，小核成卵圓狀位於大核旁，具有許多消化食泡及2~3個伸縮液泡，其大小約為長33.6-47.6 um (平均40.3 u)寬23.0-44.2 um(平均33.0 um)具大型的核約7.8-13.3 um x 7.8-12.3 um，許多文獻提到其大小變化甚巨
人畜共通：非人畜共通傳染病
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牡蠣波納米亞蟲病
病原型別：原蟲（protozoa）
病原環境：海水（marine）
學名： Bonamia ostreae
病名（及俗名）：微小細胞病（Microcell disease），牡蠣血淋巴球病（Haemocyte disease of flat oyster）
最早發現者：Pichot et al. (1979) (R)
OIE狀況：表列(Listed)
病原摘要：本病原寄生於血淋球(haemocyte)內，蟲體直徑平均2至3μm；蟲體細胞質可區分成兩種不同型態，細肫質高嗜鹼性之蟲體呈圓形，直徑2至3μm，細胞核周圍有一圈蒼白暈，而細胞質低嗜鹼性之蟲體，形體較大，直徑達3至5μm。蟲體對過醋酸(peracetic acid)0.001～0.005%有感受性。
人畜共通：No
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波納米亞蟲病
病原型別：原蟲（protogzoa）
病原環境：海水（marine）
學名： Bonamia exitiosa
病名（及俗名）：微小細胞病（Microcell disease），撈捕牡蠣血淋球病（Haemocytic disease of dredge oysters）
最早發現者：Dinamani et al.（1986）
OIE狀況：表列（Listed）
病原摘要：
原蟲、本病原能生存於海水溫度18℃、48小時，蟲體大小2至3μm，目前文獻記載牡蠣波納米亞蟲（ B.ostreae）及波納米亞蟲（ B.exitiosa）外，尚有11種類似波納米亞蟲感染雙貝枚類軟體動物。
人畜共通：No
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馬爾太蟲病
病原型別：原蟲（protozoa）
病原環境：海水（seawater）
學名： Marteilia refringens
病名（及俗名）：馬爾太蟲病（Marteiliosis）、Aber病（Aber disease），由另一馬爾太蟲稱為雪梨馬爾太蟲（ Marteilia sydneyi）引發商品化囊形牡蠣（ Saccostrea glomerata）所產生的疾病稱為QX病（QX disease）；另外尚有 M. lenghei感染牡礪（Crassostrea cucullata）， M. christenseni感染（Scrobicularia piperata P）(R)等蟲體侵害養殖雙枚貝觳類之報導。
最早發現者：Grize et al.(1974)(R)
OIE現況：表列（Listed）
病原摘要：
主要感染歐洲牡蠣（European flat oyster, Ostrea edulis），引起牡蠣致死之原蟲，在感染宿主腸道及鰓上皮細胞形成（直徑5至8μm）之初級細胞或幹細胞（primary cell或stem cell），然後在宿主上皮細胞質之空泡內由初級單核細胞（primary uninucleate cell）分裂成二級單核子細胞（Secondary uninucleate darghter cell）經過一系列的增裂分裂形成直徑3.5至4.5μm，具感染性之孢子。(R)
人畜共通：No
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單倍體孢子蟲症
病原型別：原蟲（protozoa）
病原環境：海水（marine）
學名：Haplosporidium nelsoni
病名（及俗名）：單孢子蟲症（Haplosporidiosis）、X多核球形症（multinucleate sphere X, MSX）、Delaware灣症（Delaware Bay disease）、太平洋牡蠣單孢子蟲症（Haplosporidiosis of Pacific oysters）
最早發現者：Hasskin et al.（1966）
OIE狀況：表列（Listed）
病原摘要：
本病原在寄生牡蠣生活史中，具有二種型態，一為多核原生質團（multinucleate plasmodia），大小直徑5至20μm，但有時可達50μm或超過100核；第二型態為具有抵抗性之孢子，由孢壁物質衍生之外蓋或孢壁衍生物之內緣掩蔽孢孔，孢子大小隨虫體品種不同而有差異，一般從4至12μm，且孢子外飾物（spore ornamentation）由孢壁衍生物緊緻包紮或孢子尾部組成，在掃描電子顯微鏡下可當分類之依據。
人畜共通：No
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柏金絲病
病原型別：原生動物(protistozoa)
病原環境：海水
學名： Perkinsus marinus
病名(及俗名)：Dermo" Disease, Proliferative disease, Perkinsosis
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
Perkinsus marinus因具有一厚的細胞壁因此於外界相當穩定，但乾燥(dessication )、加氯處理(chlorination)及 UV 可使 Perkinsus marinus 不活化(Bushek et al 1997)。病原生活史中之任一階段皆可感染。
人畜共通：目前無法証實可感染人
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傳染性皮下及造血組織壞死症
病原型別：病毒(virus)
病原環境：海水
學名：
病名(及俗名)：侏儒畸形症
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
IHHNV為二十面體大小約20-22nm之病毒，於超高速離心下，於CsCl 之等密度為1.40 g/ml，核酸為單股DNA 病毒其大小約4.1Kb (Nunan et al 2000)。具有4個genotype (OIE 2006)，但目前所知僅其中兩個genotype 可感染白蝦( Litopenaeus vannamei ) 及/或草蝦 ( Penaeus monodon )
人畜共通：無(No)
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鏈球菌感染症
病原型別：細菌( bacteria)
病原環境：主要於淡水或半淡鹹水(brackish water and freshwater), 但偶於海水環境。
學名：主要病原有 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiae and Lactococcus garvieae 等
鏈球菌感染症最早發生於1957年地點在日本養rainbow trout (Hoshina et al. 1958). 之後陸續多種魚種後其感染含 salmon, mullet, golden shiner,pinfish, eel, sea trout, tilapia, sturgeon, and striped bass 等 (Inglis et al. 1993)。
.於本省可感染多種養殖魚種如金目鱸giant seaperch ( Lates calcarifer) 、吳郭魚tilipia( Tilapia nilotica x Tilapia aurea)、午仔striped thread fish ( Polydactylus plebeius)、及海鱺cobia ( Rachycetron canadum) 烏魚mullet及條紋鱸等魚種。
國外發生魚種鏈球菌感染症於報告中常發生於較高水溫 (Nguyen et al. 2001)，此情行與本省南部養殖魚類鏈球菌感染症常發生於夏季高水溫之情形相似
病原摘要：
OIE 現：未表列(Not listed)
人畜共通：人畜共通 (如 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiaer 皆有感染人之病例)
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