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黃麴毒素中毒
黃麴毒素中毒是由於動物對於黴菌中的黃麴菌屬 、Aspergillus parasiticus等之代謝產物的毒力作用具有感受性的一種疾病，這些黴菌在含的油質的植物上生長得最好；黃麴毒素的產生與黴菌生長一樣，受到飼料保存場所的一些環境因素影響（濕度、溫度及其他）；黃麴毒素為高耐熱性，可抵擋300℃的高溫，黃麴毒素有好幾種，其中以aflatoxin B1毒性最強。
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魚類立克次體症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡水及海水
學名： Piscirickettsia salmonis
病名(及俗名)：Salmonid rickettsial septicemia (SRS), Coho salmon syndrome
最早發現者： Bravo等(1989).在智利發現本症，Fryer 等(1990, 1992)分離及正式命名。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：革蘭氏陰性、營養需求高、絕對魚類細胞質內生長的細菌。親緣關係上，它與Coxiella 及 Francisella 有些微親緣關係。.
命名沿革：最早由Fryer 等(1992) 命名 。
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鯉魚春季毒血症
病原型別：病毒
病原環境：淡水
學名：Spring viremia of carp virus
病名(及俗名)：SVC, Rhabdovirus carpio
最早發現者：Fijan et al. (1971)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本病毒暫時分類於棒狀病毒科(Rhabdoviridae)，疱病毒屬(Vesiculovirus)。由單鏈、負股核醣核酸組成。基因組包含11019個核苷酸，可轉譯出5個結構蛋白質：核蛋白（nucleoprotein, N）、磷蛋白（phosphoprotein, P）、基質蛋白（matrix protein, M）、醣蛋白（glycoprotein, G）及核醣核酸相關聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, L）。 五個結構蛋白質在基因組上排列順序為3’-N-P-M-G-L- 5’。
P及N蛋白與病毒的基因組相接合，與病毒的轉錄及複製有關
G蛋白在病毒表面形成三聚體包膜突起，與細胞上的接受體結合可引起胞吞作用。G蛋白同時具有可引起魚類中和抗體的抗原決定位 。L蛋白為核醣核酸聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase) ，與複製有關 。
魚類棒狀病毒（piscine rhabdovirus）分為四個基因型。第一基因型（SVCV）、第二基因型（grass carp rhabdovirus）、第三基因型（pike fry rhabdovirus） 及第四基因型（tench rhabdovirus）。 第一基因型 (SVCV) 又細分為四個基因亞型：Ia基因型病毒(亞洲)、Ib及Ic基因型病毒(摩爾達維亞Moldova，烏克蘭及蘇俄)，Id基因型病毒(英國，前蘇聯) 。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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隱鞭毛蟲症
病因： Cryptobia spp.
症狀：眼球 突出、 脾臟腫大、 全身性水腫、 腹部膨大、 腹水、厭食、
游泳能力降低、小球性低色性貧血、免疫力低下、庫姆氏 (Coomb’s) 試驗陽性。
魚種：所有品種的太平洋鮭魚 (Pacific salmon, Oncorhynchus spp.) 及溪鮭 (brook charr, Salvelinus fontinalis)
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奴卡氏菌症
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 海水
學名： Nocardia seriolae
病名(及俗名)：奴卡氏菌感染症
最早發現者：Kudo et al. 1988, sp. nov.
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陽性、細長 絲狀菌、Catalase陽性，因細胞壁含有分枝酸(mycolic acid)，所以染色具部份抗酸性。有些 魚類的奴卡氏菌感染病例常被誤認為是分枝桿菌感染，因為這兩者都會產生相似的臨床症狀及病理學變化。世界上首例 魚類的奴卡氏菌感染症是在霓虹燈魚上發現到的(Valdez and Conroy, 1962)。 Nocardia seriolae在人工養殖的黃尾魚(青魽鯵)及日本比目魚上被分離出來(Kudo et al., 1988)
人畜共通：非人畜共通
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河鯰病毒病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水
學 名： Ictalurid herpesvirus 1
病名(及俗名)：Channel catfish virus disease
最早發現者：發現於1968年 病毒確認於1971年
OIE狀況：未表列(Not Listed)
河鯰 病毒病為一病程迅速且具高度傳染性的 病毒性疾病，發生於養殖的幼年河鯰。
本病非人畜共通傳染病
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傳染性造血組織壞死症
病原型別：virus(病毒)
病原環境：fresh water or sea water(淡水或海水)
學名：
病名(及俗名)：
最早發現者：於1940-1950年間於北美太平洋岸區於幼鮭魚發生嚴重疫情，之後認定是感染IHNV(wolf 1988)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
IHNV 病毒為 Novirhabdovirus 病毒外觀形狀為子彈樣(bullet shaped)，一般大小為長度約150-190nm間直徑約65-75nm(Roberts 2001)，為一negative-sense 單股RNA病毒，分子大小約11,000 個nucleotides 轉譯後具有6個病毒蛋白分別為 nucleoprotein (N), phosphoprotein (之前稱為 M1), a matrix protein (之前稱為 M2), glycoprotein (G), non-virion protein (NV), and 及 polymerase (L)。
病毒對熱(heat)、酸(acid)及 乙醚(ether)不穩定。但於淡水中至少可存活1個月，特別於水中富有有機物質(organic material)時會更穩定，一般之消毒劑或乾燥可不活化病毒(wolf 1988)。
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鏈球菌感染症
病原型別：細菌( bacteria)
病原環境：主要於淡水或半淡鹹水(brackish water and freshwater), 但偶於海水環境。
學名：主要病原有 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiae and Lactococcus garvieae 等
鏈球菌感染症最早發生於1957年地點在日本養rainbow trout (Hoshina et al. 1958). 之後陸續多種魚種後其感染含 salmon, mullet, golden shiner,pinfish, eel, sea trout, tilapia, sturgeon, and striped bass 等 (Inglis et al. 1993)。
.於本省可感染多種養殖魚種如金目鱸giant seaperch ( Lates calcarifer) 、吳郭魚tilipia( Tilapia nilotica x Tilapia aurea)、午仔striped thread fish ( Polydactylus plebeius)、及海鱺cobia ( Rachycetron canadum) 烏魚mullet及條紋鱸等魚種。
國外發生魚種鏈球菌感染症於報告中常發生於較高水溫 (Nguyen et al. 2001)，此情行與本省南部養殖魚類鏈球菌感染症常發生於夏季高水溫之情形相似
病原摘要：
OIE 現：未表列(Not listed)
人畜共通：人畜共通 (如 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiaer 皆有感染人之病例)
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蛙病毒感染症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水
學名：Frog Virus 3 (FV-3)
病名(及俗名)：蛙 病毒感染症、蛙 病毒病
最早發現者：Granoff, A., Came, P. E. and Breeze, D. C. (1966)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
病毒顆粒大，直徑介於120 至 300 nm，二十面體，直線型雙股DNA 病毒。 典型蛙 病毒基因組大小為100-210 kbp，環狀排列並且終端重複， 病毒可具封套(由細胞膜來)或不具封套（於細胞質內及核內複製時）。
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阿米巴原蟲感染症
病原型別： 寄生蟲
病原環境：淡、 海水
學名：Amoebosis
ＯＩＥ狀況：非表列
人畜共通：非人畜共通
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分枝桿菌感染症
病原型別： 細菌
病原環境：淡、 海水
學名：Mycobacteriosis
病名(及俗名)： 魚類結核病(Fish tuberculosis; piscine tuberculosis)、游泳池 肉芽腫(Swimming Pool Granuloma)、水族館 肉芽腫(Fish Tank Granuloma)
最早發現者：Bataillon等人於1897年首次報告抗酸菌感染 淡水魚類（ 鯉魚）。
ＯＩＥ狀況：非OIE表列傳染病
人畜共通：人畜共通。
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盾狀纖毛蟲感染症
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 海水
學名： Scuticociliatia
病名(及俗名)：盾狀纖毛蟲感染症
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：非表列
人畜共通：非人畜共通
病原摘要：纖毛蟲的長度約30 -40 μm，寬度約18 -20 μm，細長呈紡錘狀，後部呈 圓形而 頭部呈尖細。後部可見能收縮的液泡，在中央可見球狀的巨核與小核，身體覆蓋纖毛，體前部2/3包括由dikinetids組成的11到14排的睫狀層(運動)，纖毛蟲的尾部較狹長。細胞肛門位在非纖毛的頂部中心，也就是位在最初與最後的運動區域和下面的口器。口器口在前半部的細胞觀察到，雖然 口部的纖毛不能完整的見到，盡可能的見到右邊的側口膜。
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縧蟲感染症
病原：縧蟲（Cestoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 海水（marine、brackish & freshwater）
學名：例︰
(1)廣節裂頭縧蟲（ Diphyllobothrium latum）
(2)腸舌狀縧蟲（ Ligula intestinalis）
(3)鱊頭槽縧蟲（ Bothriocephalus acheilognathi）
(4)九江頭槽縧蟲（B. gowkongensis），同義於(3)之命名
(5) 其他縧蟲（Other cestodes）
病名（及俗名）：(1)鱊頭槽縧蟲稱為亞洲魚縧蟲（Asian fish tapeworm）或錦鯉縧蟲（Koi tapeworm）
(2)腸舌狀縧蟲稱為舌狀縧蟲病（Ligulosis）
最早發現者：例︰
(1)腸舌狀縧蟲 ( L. intestinalis )；Linnaeus 1758, Gmelin, 1790.
(2)鱊頭槽縧蟲 ( B. acheilog nathi ), Yamaguti, 1934.
(3)廣節裂頭縧蟲 ( D. latum ), Linnaeus, 1758.
OIE狀況：未表列（Not Listed）
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