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哈維氏弧菌
病原環境：近岸溫暖海水、沈積物、海洋動物體表、頭足動物
學名： Vibrio harveyi
病名(及俗名)：哈維氏弧菌(鯊魚弧菌)
最早發現者：Johnson et al. 1936
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性，發光呈彎曲短桿菌，大小約1.0～1.6×0.5～0.7μm，具發酵能力，運用極端鞭毛和/或側邊鞭毛來進行運動。生化特性為 catalase、oxidase、nitrate、lysine decarboxylase、ornithine decarboxylase 陽性，但不具產生arginine dihydrolase、β-galactosidase、urease和H 2S的能力。可在含3～8％(w/v)氯化鈉的環境中和11～40℃的溫度下生長，而無法在含0％或10％(w/v)氯化鈉的環境中生長。基因組DNA的G + C 含量為46-48%[5]。
人畜共通：是
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頭洞症
1.病原型別：原虫（protozoa）
病原環境： 海水、 淡水（marine、freshwater）
學名： Hexamita spp.（旋核六鞭毛虫； Spironucleus vortens, Paull & Matthews,2001）
病名（及俗名）：旋核六鞭毛症（Spironuclosis）或六鞭毛虫症（Hexamitosis）、頭洞症（Hole in the Head, HITH）
最早發現者： Spironucleus vortens（Amlacher 1970, Molanr 1974, Paull & Matthews, 2001, R）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
本病原可感染 淡水及 海水熱帶觀賞 魚類，本虫體基本形態與六鞭毛虫類似，其滋養體（trophozoite）外形呈延長虫體而體後端形成緊貼狀，具有2個香腸型之旋核，位於虫體鄰近頂部而在虫體前端部位形成為馬靴形複合物，虫體最前端部有一馬靴形上核纖維輪廓，二個相對狹窄外形之胞口，從胞口處之尾部 突出長鞭毛。在電子顯微鏡下，與六鞭毛虫主要區別為延長的虫體上具有明顯側複合物脊（lateral compound ridge）及 週邊脊（peripheral ridge）、虫體後部區於 週邊脊處具有精心渦捲（elaborate swirls）及每一鞭毛末端基部含有乳突狀構造（papilla），且第一鞭毛平展最末端含有一小球莖（small bulb）（R）。
人畜共通：No
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肝類臘質變性
本病多發生在集約式養殖型態，尤其在鮭鱒類，虹鱒特別容易發生。
1.病因：飼料中含過量的不飽和脂肪酸。
a.餵飼品質不良之飼料（例如腐敗含臭油味的魚粉及肉骨粉），飼料中含大量過氧化的不飽和脂肪酸，破壞魚體的Vit.A及E（尤其Vit. E為天然的強抗氧化劑，
在正常的情況下可保護細胞膜的脂肪酸）。
b.集約養殖的魚類，因過多的脂肪堆積於肝細胞，當不飽和脂肪酸大量增加時，由於缺乏生物的抗氧化劑，引發自體氧化作用（self-cxidation）而形成類臘質
（ceroid），類臘質為黃棕色的色素，堆積在肝細胞造成肝類臘質變性。
Ceroid最早在1941年於肝硬化的小白鼠發現，在H&E切片下，它是黃色顆粒
狀色素，其特性為：在石腊切片下為嗜蘇丹紅（sudanphilic）、抗酸性（acid-fast）、
嗜鹼性（basophilic）、等向性（isotropic）、鐵為陰性（iron negtive），為脂溶性，
不溶於水及酒精，以麥洛利氏血棕質染色（Mallory’s hemofuscin stain）及魏勾
德氏髓鞘染色（Weigert’s myelin stain）皆陽性，可還原鋨酸酐（Osmium tetroxide）
及碳酸二胺銀（diamine silver carbonate），但無法還原亞鐵氰化鐵（ferric
ferricyanide），格美林氏反應（Gmelin reaction）為陰性，於波長3650-3660Å可
見黃綠色螢光，在過甲酸或過碘酸（performic or periodic acid）氧化之後，不
論是否事先經澱粉糖化酵素消化，以席夫（Schiff）試驗測試醛類為陽性。（Wood
and Yasutake 1955）
2.症狀：發病魚隻呈深色的色素沈著、貧血及 停止攝食，結果導致病魚生長遲緩及高死亡率。
3.解剖病變： 肝臟腫大呈淺棕色， 膽囊充滿清澈的液體，腸管呈灰白色，腸壁變薄及鬆弛， 胃排空含少量透明白色液體，鰓呈明顯的貧血，此與血液相發生相當大的改變有關，因為紅血球數及血紅素減少所致。
4.組織病變：於肝細胞內可見ceroid，ceroid色素顆粒輪廓分明，分為兩種型態，
單一的小滴（single globules）或較為濔漫性的細小的顆粒狀（finely granular），
小滴型其抗酸性及各種染色性皆較強。（Wood and Yasutake 1955）
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六鞭毛蟲症
1.病原型別：原蟲（protozoa）
病原環境： 海水、 淡水（marine、freshwater）
學名： Spironucleus salmonis n. comb Poynton et al. 2004, （ Octomitus salmonis sensu Moore 1922, Davis 1926）、（ Hexamita salmonis sensu Ferguson 1979）
病名（及俗名）：六鞭毛蟲症（Hexamitosis）、於2004發表更改為旋核六鞭毛蟲症（Spironucleosis）
最早發現者：Moore et al.（1922）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
具四對鞭毛，其中前鞭毛3對，後鞭毛1對，並形成軸桿。胞核1對，在蟲體前端呈八字排列，蟲體一般呈棃形、後端尖銳，無切口及胞口，軸桿的結構較複雜，由1對副原纖維的空管，其中包裹著後鞭毛，通過蟲體向後延伸，毛基體在胞核之前。後鞭毛沿著蟲體部份與胞質相連，成為軸桿。蟲體之滋養型態一般呈卵 圓形，兩側對稱，背腹扁平。滋養體在宿主 腸管內繁殖分裂，最後形成卵 圓形包囊， 包囊可在水中生活數天，最多7天。
人畜共通：No
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魚類球蟲症
病原型別：原虫（Protozoa）
病原環境： 海水、半 淡水鹼水及 淡水（marine, brackish & fresh water）
學名：有多種球虫種類，目前文獻記載計有Cryptosporidium spp., Isospora spp., Octosporella spp., Calyptospora spp., Goussia spp., Crystallospora spp., Epieimeria spp., Eimeria spp., 計8種虫體，其中以艾美球虫（ Eimeria spp.）感染種類最多，依Duszynski et al., 2000報告，超過1300種艾美球虫，被感染約有500種變溫動物（包括 魚類、爬虫類及 兩棲類）。
病名（及俗名）： 魚類球虫症（Coccidiosis of fish、piscine coccidiosis）
最早發現者：Eimeria Schneider,（1875）；Goussia Labbe,（1896）；Octosporella Ray & Raghavachari,（1942）；Calyptospora Overstreet et al.,（1984）；Epieimeria Dykova & Lom,（1981）；Isospora, Schneider,（1881）；Crystallospora Labbe,（1899）；Cryptosporidium Tyzzen,（1907）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
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複殖類感染症
病原型別：吸蟲綱複殖吸蟲（digenean）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine、brackish & freshwater）
學名：複殖吸虫種類繁多，約有140餘科1,400多屬，萬種以上，佔吸蟲綱的大部份。本章元只能擇其重要性，並造成人畜共通的病原，作為介紹。
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甲魚阿米巴原蟲感染症
阿米巴為重要的疾病病原，目前並未歸類在各門或各類中(Lee et al., 2000)。阿米巴具有偽足(i.e.,假腳)。阿米巴感染症為重要的臨床疾病，並感染在圈養的龜類和蛇類，而有幾種阿米巴會感染在 爬蟲類(Barnard and Upton, 1994)。顯然此原蟲可與爬蟲共生， 其他像是 Entamoeba invaden是重要的病原體。
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