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對蝦桿狀病毒症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名： Baculovirus penaei
病名(及俗名)：
最早發現者：最早由Couch(1974)、Summer(1977)發現。
OIE狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
目前暫定於 Nucleopolyherdovirus屬。至少存在來至三個不同地域的 病毒株，(1) 美國大西洋東南海域及墨西哥沿岸及加勒比海(2)南、中及北美洲(3)夏威夷。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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線蟲感染症
1.病原概述
病原型別：寄生蟲
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：可參考Anderson’s system (Anderson RC, 2000)
病名(及俗名)：主要依感染種類及部位命名
最早發現者：歐洲淡水魚線蟲參考(Avdeev et al, 1987; Moravec 1994)；北美參考( Hoffman, 1999)；新熱帶區 (Moravec, 1998)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
雌雄異體，大多數為卵生，少數為胎生。仔蟲須先被中間宿主（甲殼類）吞食，中間宿主再被魚類#(B01)#吞食才能完成寄生。若魚類為終宿主則在此完成生活史。若魚類僅為中間宿主，則僅被包被在魚體，必須再被其終宿主（鳥類、人類或另一種魚類）吞食才能完成生活史。所有魚種均會感染；宿主主要依線蟲的終宿主及中間宿主而定。具有特定宿主的線蟲(例如 Skrjabillanid genera)通常僅能感染某棲息地的魚種；具有廣泛宿主的線蟲(例如 Capillaria sp.)則可感染世界上許多地區的魚種。
人畜共通：有些寄生蟲，例如海獸胃線蟲( Anisakis)及Pseudo -terranova仔蟲會造成人畜共通傳染病。
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壞死性肝胰腺炎
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：壞死性肝胰腺炎細菌NHP bacterium (NHPB)
病名(及俗名)：壞死性肝胰腺炎、德州蝦池死亡症候群 Texas Pond Mortality Syndrome (TPMS)、 祕魯壞死性肝胰腺炎 Peru necrotizing hepatopancreatitis( PNHP)
最早發現者：最早由Frelier等 (1992)在美國德州太平洋白蝦養殖場發現。
OIE狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
壞死性肝胰腺炎細菌為葛蘭氏陰性染色、多形性、胞內寄生的立克次體樣細菌，分散在於感染的肝胰腺細胞胞質內。本菌主要的型態為桿狀立克次體樣細菌 (0.25 x 0.9 um)，偶而以基底端含有八條鞭毛，頂端有一至二條鞭毛的螺旋體(0.25 x 2-3.5 um)出現。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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草蝦桿狀病毒症
1.病原概述
病原型別：病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：Penaeus monodon baculovirus
病名(及俗名)：Spherical baculovirosis (Penaeus monodon-type baculovirus infection)
最早發現者：Lightner & Redman (1981)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
本病毒一般稱為Penaeus monodon baculovirus (MBV)，國際病毒分類學會暫時命名為singly enveloped nuclear polyhedrosis virus from Penaeus monodon( PmSNPV) ，位於Nucleopolyherdovirus屬。由於本病毒感染的宿主及地理分佈極廣，存在不同病毒株可能性極高。此點可由最近的發現印證，以東南亞MBV分離株所設計的PCR無法檢驗出由於非洲的MBV的分離株。
人畜共通：否
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鰻魚凹凸病
1.病原概述
病原型別：寄生蟲
病原環境：淡水、淡鹹水及鹹水
學名：Pleistophora anguillarum
病名(及俗名)：Beko Disease
最早發現者： Hoshina(1951).在日本鰻發現本症。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：本孢子為長卵圓形，後部有個佔全長2/3長度的空泡。孢子大小為2.4 um x 7.8 um。
病原分類：
微孢子門 (Microspora)、微孢子目(Microsporida)、Pansporoblastina亞目、Pleistophora屬、anguillarum種。
別名：Plistophora anguillarum ，Heterosporis anguillarum
命名沿革：最早命名為Pleistophora anguillarum (1959)，後來Lom等(2000)依據超顯微結構建議改歸類於另一屬Heterosporis。
疾病特性：
（感染組織及器官：感染路徑、好發組織器官、宿主）
目前證實水平感染，主要感染日本鰻。人工感染，其感受性依次為鱸鰻（Anguilla mormorata）、日本鰻（Anguilla japonica）、美洲鰻（Anguilla rostrata）。本症主要感染橫紋肌。體液免疫方面，感染凹凸病原蟲後之日本鰻線在第 6週才有較明顯的抗體陽性
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櫻鱒病毒病
1.病原概述
病原型別：病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：Oncorhynchus masou virus
病名(及俗名)： Oncorhynchus masou virus disease, OMVD, OMV
最早發現者：最早由Kimura 等(1981)發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
本病毒一般稱為 Oncorhynchus masou virus (OMV)，目前暫定於 Herpesviridae科。本病毒為具有封套、20面體、大小120-200 nm、 dsDNA病毒。本病毒抗原性與出現在美國西岸的herpesvirus of Salmonidae type 1(SalHV-1)不同。暫定為 Salmonid herpesvirus 2; SalHV-2。
人畜共通：否
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偽單胞菌感染症
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名： Pseudomonas fluorescens及 Pseudomonas anguilliseptica.
病名(及俗名)： 偽單胞菌敗血症Pseudomonad septicaemia ( P. fluorescens)，紅點病（赤點病）red spot disease 或 red pest ( P. anguilliseptica)。
最早發現者：Plehn (1924) 在鯉魚發現P. fluorescens。Wakabayashi (1972)在日本鰻發現P. anguilliseptica。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
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嘉魶虹彩病毒病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水學名：Red sea bream iridovirus (RSIV)
病名(及俗名)：RSIV
最早發現者： Inouye 等(1992)發現RSIV。 He等（2001）發現ISKNV。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
本病（Red sea bream iridoviral disease）由兩個病原引起：嘉魶虹彩病毒（Red sea bream iridovirus及傳染性脾臟與腎臟壞死病毒（infectious spleen and kidney necrosis virus , ISKNV）。
人畜共通：非人畜共通。
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種蝦分離之致死病毒症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：Spawner-isolated mortality virus
病名(及俗名)：Spawner-isolated mortality virus disease, SMVD, SM
最早發現者：澳洲Fraser & Owen (1996) 在草蝦發現。Albaladejo 等（1998）在菲律賓草蝦亦有相同發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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套拉症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：Taura syndrome virus
病名(及俗名)：套拉症
最早發現者：最早由Bonami(1997)、Mari (2002)發現。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本 病毒目前暫定在Dicistroviridae科。 病毒顆粒為 32 nm，不含封套、二十面體、、浮力密度為1.338 g/ml。基因組為線狀、正端單股RNA 病毒，由10205個核苷酸組成。不具有3’ poly-A 尾巴。基因組包含兩個大的開放讀取區(ORF)；ORF 1 包括非結構蛋白，ORF 2包括結構蛋白，三個主要核衣蛋白為 VP1, VP2, VP3 (55, 40及24 kDa)。 病毒在細胞質內複製。
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白尾症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水及 淡鹹水
學名：Baculovirus penaei Macrobrachium rosenbergii Nodavirus (MrNV).
病名(及俗名)： WTD, White muscle disease (WMD)
最早發現者：最早Arcier等 (1999)發現。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
MrNV為二十面體、無封套 RNA 病毒，大小為26–27 nm 。 病毒在組織中的結締組織細胞核內增殖。基因組由兩段RNA組成，capsid protein為43 KDa。XSV是一個衛星病毒，大小為14–16 nm, 常伴隨 MrNV出現；基因組由一段RNA組成，capsid protein為17 KDa。發病蝦常可同時發現這兩種病毒，暗示與本病有關，但真正角色尚未明瞭。
.人畜共通：非人畜共通傳染病
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魚蝨感染症
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水、title="海水">海水
學名：Argulus foliaceus ; Argulus japonicus ; Argulus coregoni
病名(及俗名)：魚蝨感染症
最早發現者：
Argulus japonicus Thiele, 1900
Argulus foliaceus (Linnaeus), 1758
Argulus coregoni Thorell, 1865
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
魚蝨曾在17世紀時歐洲養殖的鱒魚及中國的 鯉魚發生過(Wilson,1902; Kabata,1985)。魚蝨在湖、河口及 海水鮭魚箱網都曾發生過且會造成死亡。在 鯉魚及金魚感染此病症後易繼發 黴菌及 細菌二次性感染，造成經濟上的損失(Shimura,1982a)。另外在1985年Ahne報告魚蝨亦為傳染SVC的媒介。Branchiurans亞綱裡，其蟲體型態為卵圓型，外層為 甲殼覆蓋。有一對 突出複眼，口器及觸角特化成勾型，有多刺的突起的吸盤，其構造是為了適應 寄生蟲生活。為了配偶及產卵，他們會離開宿主長達三個星期，然後在次附著魚的 鰓蓋內側，靠著黏液為生，然後蛻皮，或者是靠穿透 皮膚吸收內在養份為生。
人畜共通：非人畜共通
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卵圓鞭毛蟲
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 半鹹水、 海水
學名： Amyloodinium ocellatum
病名(及俗名)：卵圓鞭毛蟲感染症(Amyloodiniasis)、絲絨病(Velvet disease)、銹病(Rust disease)、金粉症(Gold rust disease)
最早發現者：Brown, (1931)
ＯＩＥ狀況：非表列(Not Listed)
病原摘要：
卵圓鞭毛蟲 營養體以碟狀構造吸附於宿主，此碟狀構造具有一非常短的柄，且於吸盤的周圍有一圈 絲狀的假根可深入宿主的上皮細胞，ㄧ觸手狀的構造自細胞基底部延伸出，其功能尚未明瞭，細胞質缺乏葉綠粒但具有消化食泡及澱粉顆粒和多種特殊胞器， 營養體呈梨狀或卵圓狀，體長約150~350 um。
人畜共通：非人畜共通
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傳染性造血組織壞死症
病原型別：virus(病毒)
病原環境：fresh water or sea water(淡水或海水)
學名：
病名(及俗名)：
最早發現者：於1940-1950年間於北美太平洋岸區於幼鮭魚發生嚴重疫情，之後認定是感染IHNV(wolf 1988)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
IHNV 病毒為 Novirhabdovirus 病毒外觀形狀為子彈樣(bullet shaped)，一般大小為長度約150-190nm間直徑約65-75nm(Roberts 2001)，為一negative-sense 單股RNA病毒，分子大小約11,000 個nucleotides 轉譯後具有6個病毒蛋白分別為 nucleoprotein (N), phosphoprotein (之前稱為 M1), a matrix protein (之前稱為 M2), glycoprotein (G), non-virion protein (NV), and 及 polymerase (L)。
病毒對熱(heat)、酸(acid)及 乙醚(ether)不穩定。但於淡水中至少可存活1個月，特別於水中富有有機物質(organic material)時會更穩定，一般之消毒劑或乾燥可不活化病毒(wolf 1988)。
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傳染性皮下及造血組織壞死症
病原型別：病毒(virus)
病原環境：海水
學名：
病名(及俗名)：侏儒畸形症
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
IHHNV為二十面體大小約20-22nm之病毒，於超高速離心下，於CsCl 之等密度為1.40 g/ml，核酸為單股DNA 病毒其大小約4.1Kb (Nunan et al 2000)。具有4個genotype (OIE 2006)，但目前所知僅其中兩個genotype 可感染白蝦( Litopenaeus vannamei ) 及/或草蝦 ( Penaeus monodon )
人畜共通：無(No)
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傳染性肌肉壞死病
病原型別：病毒(virus)
病原環境：主要於海水及半淡鹹水 (brackish and marine water)
病名(俗名)
最早發現者：2002年時於巴西第一次發生傳染性肌肉壞死病毒（Infectious Myonecrosis Virus, IMNV) 主要危害白蝦（南美白對蝦， L. vannamei）， IMNV 為一個全新的病毒(Lightner et al 2004; Poulos et al 2006) 之後於亞洲之印尼亦發生同樣疾病 (Senapin et al 2007)
OIE 狀況：listed under article 1.2.3. of the aquatic code
病原摘要：IMNV病毒顆粒為二十體直徑約40nm (fig. 1)，於離心下在cesium chloride之buoyant sensity密度為1.366g/mL，為雙股之RNA病毒其基因體為7,560bp。
人畜共通：無
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鏈球菌感染症
病原型別：細菌( bacteria)
病原環境：主要於淡水或半淡鹹水(brackish water and freshwater), 但偶於海水環境。
學名：主要病原有 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiae and Lactococcus garvieae 等
鏈球菌感染症最早發生於1957年地點在日本養rainbow trout (Hoshina et al. 1958). 之後陸續多種魚種後其感染含 salmon, mullet, golden shiner,pinfish, eel, sea trout, tilapia, sturgeon, and striped bass 等 (Inglis et al. 1993)。
.於本省可感染多種養殖魚種如金目鱸giant seaperch ( Lates calcarifer) 、吳郭魚tilipia( Tilapia nilotica x Tilapia aurea)、午仔striped thread fish ( Polydactylus plebeius)、及海鱺cobia ( Rachycetron canadum) 烏魚mullet及條紋鱸等魚種。
國外發生魚種鏈球菌感染症於報告中常發生於較高水溫 (Nguyen et al. 2001)，此情行與本省南部養殖魚類鏈球菌感染症常發生於夏季高水溫之情形相似
病原摘要：
OIE 現：未表列(Not listed)
人畜共通：人畜共通 (如 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiaer 皆有感染人之病例)
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淋巴囊腫病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水、半淡鹹水及 海水魚皆有感染紀錄(fresh-water, brackish and sea- water)。
學名：
病名：淋巴囊腫病
最早發現者：Lowe 1874
病原摘要： 病毒顆粒為正20 面體大小於130-380nm 之間。 病毒顆粒於外膜具有明顯之fuzzy filaments之結構。
人畜共通：不會
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毒藻；紅潮
水中有毒藻類過度繁殖造成其他的水中生物危害，一般稱為「紅潮」係泛指由單細胞浮游藻類過度生長引起一種水生現象，是一個通常用辭，可發生在全球各個國家地區的海洋、近海沿岸、海灣、 淡水及湖泊，其造成因素之一與人類活動，氮磷營養原之升高的污染有關，故河川滙入處之河口湖岸等也皆可發生，地球氣候變化水溫升高之聖嬰現象也會影響。科學家較喜歡用的名詞是藻華Algal bloom。
藻華形成時顏色並不都是紅色，依藻相和生長的密度，顏色從無大變化到綠色
、棕色，也可能粉紅色到紫色，有時呈暗濁。魚場之魚群不特定的會報告死亡疫情，藻類生長密度甚高時，對岸邊活動人類也會經由空氣吹散而致身體不適，游泳是安全的但可能會有 皮膚、黏膜的刺激。對水生動物之危害報告較一般性，1994在南非發生的赤潮導致數仟噸所有魚種及甲殼類的死亡，1987有研究學者報告座頭鯨等海洋哺乳動物因赤潮而大量死亡，日本瀨戶內海也曾有相似的漁業災情。因此研究人員較常用稱「Harmful algal bloom, HAB.」。
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