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對蝦桿狀病毒症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名： Baculovirus penaei
病名(及俗名)：
最早發現者：最早由Couch(1974)、Summer(1977)發現。
OIE狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
目前暫定於 Nucleopolyherdovirus屬。至少存在來至三個不同地域的 病毒株，(1) 美國大西洋東南海域及墨西哥沿岸及加勒比海(2)南、中及北美洲(3)夏威夷。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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壞死性肝胰腺炎
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：壞死性肝胰腺炎細菌NHP bacterium (NHPB)
病名(及俗名)：壞死性肝胰腺炎、德州蝦池死亡症候群 Texas Pond Mortality Syndrome (TPMS)、 祕魯壞死性肝胰腺炎 Peru necrotizing hepatopancreatitis( PNHP)
最早發現者：最早由Frelier等 (1992)在美國德州太平洋白蝦養殖場發現。
OIE狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
壞死性肝胰腺炎細菌為葛蘭氏陰性染色、多形性、胞內寄生的立克次體樣細菌，分散在於感染的肝胰腺細胞胞質內。本菌主要的型態為桿狀立克次體樣細菌 (0.25 x 0.9 um)，偶而以基底端含有八條鞭毛，頂端有一至二條鞭毛的螺旋體(0.25 x 2-3.5 um)出現。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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牡蠣奴卡氏菌症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 海水
學名： Nocardia crassostreae
病名(及俗名)：
Nocardiosis, Fatal inflammatory bacteraemia (FIB), Focal necrosis, Multiple abscesses, Summer mortality, Pacific oyster nocardiosis (PON).
最早發現者：最早由Friedman等 (1987)分離本菌。
OIE狀況：未表列(Not listed)。
病原摘要：
本菌 Nocardia crassostreae會引起太平洋牡蠣 Pacific oysters, Crassostrea gigas局部或全身疾病。本菌為好氣性生長、弱抗酸染色,、產生會分枝的不規則菌絲體； 肽聚醣 (peptidoglycan)含有meso-diaminopimelic acid ，利用arabinose 及 galactose 為主要醣源，46-58個碳原子組成的分枝菌酸、及G+C-rich 的核酸。依據部分165 rRNA gene序列分析，發現應該歸屬在 Nocardia otitidiscaviarum rRNA sub-group 下。本菌的標準株為NB4H (= ATCC 700418)。
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草蝦桿狀病毒症
1.病原概述
病原型別：病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：Penaeus monodon baculovirus
病名(及俗名)：Spherical baculovirosis (Penaeus monodon-type baculovirus infection)
最早發現者：Lightner & Redman (1981)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
本病毒一般稱為Penaeus monodon baculovirus (MBV)，國際病毒分類學會暫時命名為singly enveloped nuclear polyhedrosis virus from Penaeus monodon( PmSNPV) ，位於Nucleopolyherdovirus屬。由於本病毒感染的宿主及地理分佈極廣，存在不同病毒株可能性極高。此點可由最近的發現印證，以東南亞MBV分離株所設計的PCR無法檢驗出由於非洲的MBV的分離株。
人畜共通：否
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水黴菌感染症
病原型別：黴菌
病原環境：淡水及淡鹹水
學名： Achlya屬 及 Saprolegnia屬
病名(及俗名)：Typical water mold infection，Saprolegniosis，Oomycete infection
最早發現者：最早由Tiffeney (1939) 發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
水黴菌是目前淡水及淡鹹水魚最常見的黴菌病原。主要病原來自卵菌綱(Class Oomycetes)、水黴菌目 ( Saprolegniales)、水黴菌科( Saprolegniaceae)下的綿黴菌屬( Achlya)及水黴菌屬( Saprolegnia)兩屬。水黴主要是一種利用腐敗有機質為食物的機緣性腐生病原。最常分離到的水黴菌為： Saprolegnia parasitica及 S. diclina。
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鰻魚凹凸病
1.病原概述
病原型別：寄生蟲
病原環境：淡水、淡鹹水及鹹水
學名：Pleistophora anguillarum
病名(及俗名)：Beko Disease
最早發現者： Hoshina(1951).在日本鰻發現本症。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：本孢子為長卵圓形，後部有個佔全長2/3長度的空泡。孢子大小為2.4 um x 7.8 um。
病原分類：
微孢子門 (Microspora)、微孢子目(Microsporida)、Pansporoblastina亞目、Pleistophora屬、anguillarum種。
別名：Plistophora anguillarum ，Heterosporis anguillarum
命名沿革：最早命名為Pleistophora anguillarum (1959)，後來Lom等(2000)依據超顯微結構建議改歸類於另一屬Heterosporis。
疾病特性：
（感染組織及器官：感染路徑、好發組織器官、宿主）
目前證實水平感染，主要感染日本鰻。人工感染，其感受性依次為鱸鰻（Anguilla mormorata）、日本鰻（Anguilla japonica）、美洲鰻（Anguilla rostrata）。本症主要感染橫紋肌。體液免疫方面，感染凹凸病原蟲後之日本鰻線在第 6週才有較明顯的抗體陽性
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亞硝酸中毒
亞硝酸通常伴隨著 硝酸及氨氮存在於水的表面，不過他們的濃度一般都很低，因為他們極不穩定，很容易氧化還原，最後分解為有機氮化合物，所以在水面及土壤中幾乎没有 亞硝酸，會造成污染，大多由於農場使用含氮的肥料或糞肥，沖刷到水體所致。（Svobodová, 1991）
另外在 淡水養殖場，亞硝酸中毒很容易發生在新建立的養殖系統，稱為新池症候群（New Tank Symdrome），因為新的養殖池中硝化細菌（Nitrobacter）尚未建立，養殖密度過高或過飼
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硫化氫中毒
硫化氫為具臭味的強毒性氣體，在自然的情況下，底泥的有機物質或被有機污染的水體中之蛋白質，經過厭氧性細菌分解產生硫化氫（H 2S），硫化氫在水中會解離成HS-及S 2-，其毒性依序為H 2S> HS ->S 2-，當水中的 PH值增加時，硫化氫的毒性會降低，因為未解離的強毒性的H2S變成毒性較低的HS-離子，在PH9時幾乎99%之硫化物以HS -的形式存在，PH7時HS -與H 2S以1：1的比例存在，但在PH5則幾乎99%為H 2S。（謝介士，1994）
硫化氫對魚類有很強的毒性，不同的魚種，其致死濃度範圍從0.4 mg/L（鮭鱒類）到4mg/L（歐洲 鯽魚、丁鱖及鰻魚）不等（Svobodová, 1991）。已有許多文獻報告，研究硫化氫對不同魚種的毒性作用。當藍鰓太陽魚曝露在0.04 mg/L 的H 2S下，其游泳的耐受力降低；即使H 2S的濃度在非常低的情況下，亦會傷害魚卵
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黃麴毒素中毒
黃麴毒素中毒是由於動物對於黴菌中的黃麴菌屬 、Aspergillus parasiticus等之代謝產物的毒力作用具有感受性的一種疾病，這些黴菌在含的油質的植物上生長得最好；黃麴毒素的產生與黴菌生長一樣，受到飼料保存場所的一些環境因素影響（濕度、溫度及其他）；黃麴毒素為高耐熱性，可抵擋300℃的高溫，黃麴毒素有好幾種，其中以aflatoxin B1毒性最強。
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櫻鱒病毒病
1.病原概述
病原型別：病毒
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名：Oncorhynchus masou virus
病名(及俗名)： Oncorhynchus masou virus disease, OMVD, OMV
最早發現者：最早由Kimura 等(1981)發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
本病毒一般稱為 Oncorhynchus masou virus (OMV)，目前暫定於 Herpesviridae科。本病毒為具有封套、20面體、大小120-200 nm、 dsDNA病毒。本病毒抗原性與出現在美國西岸的herpesvirus of Salmonidae type 1(SalHV-1)不同。暫定為 Salmonid herpesvirus 2; SalHV-2。
人畜共通：否
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魚類立克次體症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡水及海水
學名： Piscirickettsia salmonis
病名(及俗名)：Salmonid rickettsial septicemia (SRS), Coho salmon syndrome
最早發現者： Bravo等(1989).在智利發現本症，Fryer 等(1990, 1992)分離及正式命名。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：革蘭氏陰性、營養需求高、絕對魚類細胞質內生長的細菌。親緣關係上，它與Coxiella 及 Francisella 有些微親緣關係。.
命名沿革：最早由Fryer 等(1992) 命名 。
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偽單胞菌感染症
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名： Pseudomonas fluorescens及 Pseudomonas anguilliseptica.
病名(及俗名)： 偽單胞菌敗血症Pseudomonad septicaemia ( P. fluorescens)，紅點病（赤點病）red spot disease 或 red pest ( P. anguilliseptica)。
最早發現者：Plehn (1924) 在鯉魚發現P. fluorescens。Wakabayashi (1972)在日本鰻發現P. anguilliseptica。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
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鯉魚春季毒血症
病原型別：病毒
病原環境：淡水
學名：Spring viremia of carp virus
病名(及俗名)：SVC, Rhabdovirus carpio
最早發現者：Fijan et al. (1971)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本病毒暫時分類於棒狀病毒科(Rhabdoviridae)，疱病毒屬(Vesiculovirus)。由單鏈、負股核醣核酸組成。基因組包含11019個核苷酸，可轉譯出5個結構蛋白質：核蛋白（nucleoprotein, N）、磷蛋白（phosphoprotein, P）、基質蛋白（matrix protein, M）、醣蛋白（glycoprotein, G）及核醣核酸相關聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, L）。 五個結構蛋白質在基因組上排列順序為3’-N-P-M-G-L- 5’。
P及N蛋白與病毒的基因組相接合，與病毒的轉錄及複製有關
G蛋白在病毒表面形成三聚體包膜突起，與細胞上的接受體結合可引起胞吞作用。G蛋白同時具有可引起魚類中和抗體的抗原決定位 。L蛋白為核醣核酸聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase) ，與複製有關 。
魚類棒狀病毒（piscine rhabdovirus）分為四個基因型。第一基因型（SVCV）、第二基因型（grass carp rhabdovirus）、第三基因型（pike fry rhabdovirus） 及第四基因型（tench rhabdovirus）。 第一基因型 (SVCV) 又細分為四個基因亞型：Ia基因型病毒(亞洲)、Ib及Ic基因型病毒(摩爾達維亞Moldova，烏克蘭及蘇俄)，Id基因型病毒(英國，前蘇聯) 。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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梨形四膜蟲症
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水
學名： Tetrahymena corlissi、Tet. pyriformis、Tet. faurei、Tet. rostrata
病名(及俗名)：Tetrahymena infection、TET disease、Guppy disease
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
橢圓梨形小纖毛蟲(30-60 x 50-100 μm)，放射狀、對稱的體形，表面佈滿20-30排的纖毛縱列(Kinety)。 口腔內具有特殊的纖毛口器(oral ciliary apparatus)， 口腔右側具有側口膜(paraoral membrane)，三個連續排列的膜則位於左側。 口腔的底部為進食開口處(cytostome)。 口腔的後緣有一至三排纖毛縱列。繁殖採用二分裂法；但有些會產生生殖囊泡，內含二至八個幼蟲(tomite)。大部分對魚而言是機緣性寄生；少部分則為絕對寄生，引起魚類致死的寄生蟲。
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錐蟲病
1.病原概述
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水及 海水
學名： Trypanosoma. carassii (又名Try. danliewski)，Try. murmanense
病名(及俗名)：Trypanosomes
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
具一條鞭毛的魚類住血原蟲。常見的有2種，Try. carassii (Try. danliewski)感染淡水魚，包括 金魚、 鯉魚、丁鱖tench、 鰻魚、大眼鱖 ( Saccobranchus fossilis)。 Trp. Murmanense感染 海水魚，包括鱈魚、比目魚、 鰻魚等13種。
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渦蟲病
1.病原概述
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 海水
學名： Ichthyophaga sp., Paravortex sp.
病名(及俗名)：Tubellarian infection、 黑點病Black Ich、Tang Turbellarian 、Black spot disease、Tang disease。
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
本病由多個病原引起。蟲體呈 橢圓形、 皮膚有纖毛、具有兩個眼點。常見的病原Tang tubellarium（又名 Paravortex sp.），其生活史類似海水性白點蟲，寄生魚體6天後（大小由77 μM 變成450 μM），會離開宿主落入池底，進行3-4天增殖，大小變為750 μM；同時仔蟲也在體內孵育，最後成蟲裂開釋出聚感染性的幼蟲。在24.5oC時，完成一次生活史約需10天。另一種扁蟲 Ichthyophaga sp. 也被報導引起本病有關。
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套拉症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡鹹水及 海水
學名：Taura syndrome virus
病名(及俗名)：套拉症
最早發現者：最早由Bonami(1997)、Mari (2002)發現。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
本 病毒目前暫定在Dicistroviridae科。 病毒顆粒為 32 nm，不含封套、二十面體、、浮力密度為1.338 g/ml。基因組為線狀、正端單股RNA 病毒，由10205個核苷酸組成。不具有3’ poly-A 尾巴。基因組包含兩個大的開放讀取區(ORF)；ORF 1 包括非結構蛋白，ORF 2包括結構蛋白，三個主要核衣蛋白為 VP1, VP2, VP3 (55, 40及24 kDa)。 病毒在細胞質內複製。
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白尾症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水及 淡鹹水
學名：Baculovirus penaei Macrobrachium rosenbergii Nodavirus (MrNV).
病名(及俗名)： WTD, White muscle disease (WMD)
最早發現者：最早Arcier等 (1999)發現。
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)。
病原摘要：
MrNV為二十面體、無封套 RNA 病毒，大小為26–27 nm 。 病毒在組織中的結締組織細胞核內增殖。基因組由兩段RNA組成，capsid protein為43 KDa。XSV是一個衛星病毒，大小為14–16 nm, 常伴隨 MrNV出現；基因組由一段RNA組成，capsid protein為17 KDa。發病蝦常可同時發現這兩種病毒，暗示與本病有關，但真正角色尚未明瞭。
.人畜共通：非人畜共通傳染病
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指環蟲症
病因: Gyrodactylus spp. 及 Dactylogyrus spp. 兩者最為常見。
症狀: 活動亢進，泳態怪異，常會跳起水面或摩擦身體。魚體褪色，呼吸加快， 鰓蓋擴張，露出 腫脹、蒼白的鰓部。 皮膚會有散佈的 出血及 潰瘍灶。死亡率高。
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流行性潰瘍症候群 (真菌性肉芽腫病)
病因： Aphanomyces invadans
症狀:是由 黴菌Aphanomyces invadans引起体表 潰瘍的疾病併發機會性病原Aeromonas hydrophila and A. sobria混合感染導致大量死亡.通常是季節性疾病感染 淡水魚和半鹼水魚
魚種：鯡魚 (menhaden) 等。
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