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疥癬症/外寄生蟲感染
蟎及壁虱等吸血節肢動物。蛇蟎或稱蛇虱（Snake mite; Ophionyssus natricis)為 爬蟲類最常見之蟎類。還有另外250種 蟎類可寄生於爬蟲動物。恙蟎（Trombiculid mite)之幼體期可感染爬蟲。另外總共有7個屬的壁虱可以感染爬蟲動物，硬蜱和 軟蜱皆可在蛇、蜥蜴和龜身上發現。其中 Ixodes, Hyalomma, Haemaphysallis, Amblyomma和 Aponomma屬的硬蜱曾在多種 爬蟲類被報告過。 Argasidae和Ornithodoros屬之 軟蜱可感染蛇、蜥蜴和龜。
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黴漿菌病
病因：目前在北美洲確認主要由 Mycoplasma agassizzi和 Mycoplasma testudineum感染所引起。
症狀
化 膿性鼻分泌、結膜炎、眼分泌物、眼瞼和 眼眶周圍 水腫。
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維生素A缺乏症以及維生素A過多症
維生素A缺乏症：
病因:
飲食中缺少維生素A。
症狀:
在龜類最主要的就是眼瞼 水腫，伴隨有黃 白色細胞殘餘物在眼瞼底下，可能一眼或是兩眼。
其他可能會出現厭食、昏睡、體重下降和鼻或眼有分泌物。
箱龜會有耳朵、呼吸道的感染以及卵滯留。年幼海龜眼瞼會過度角化。腹股溝和腋窩 水腫顯示出伴隨有 腎衰竭及預後不佳。
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蛇的呼吸道疾病
鼻分泌物/鼻炎、張口呼吸、 濕式或不 正常的呼吸音、聲門周圍或近端氣管內的分泌物。務必與 食道分泌物( 胃炎/腸炎)或口炎的分泌物區分清楚，有時可能同時發生。蛇會分泌 厚且高黏性的黏液，在其飼育的 空間中可發現一團團的黏液塊。蛇不大會咳嗽且氣管相當長，因此當有黏液卡住時是相當嚴重的，可能需要氣管灌洗。另外也會有 鼻孔阻塞及突然死亡情形。
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蜥蜴的胃腸道疾病
病因：
病毒性
里奧 病毒(Reovirus)
腺 病毒(Adenovirus)，在肥尾 守宮"> 守宮有報告
細菌性
沙門氏桿菌
大腸桿菌
其他菌種
黴菌性
黴菌性腸炎(尤其在 變色龍常見)
酵母菌(yeast)感染，有些病例可能和長期投與抗生素有關
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