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疥癬症/外寄生蟲感染
蟎及壁虱等吸血節肢動物。蛇蟎或稱蛇虱（Snake mite; Ophionyssus natricis)為 爬蟲類最常見之蟎類。還有另外250種 蟎類可寄生於爬蟲動物。恙蟎（Trombiculid mite)之幼體期可感染爬蟲。另外總共有7個屬的壁虱可以感染爬蟲動物，硬蜱和 軟蜱皆可在蛇、蜥蜴和龜身上發現。其中 Ixodes, Hyalomma, Haemaphysallis, Amblyomma和 Aponomma屬的硬蜱曾在多種 爬蟲類被報告過。 Argasidae和Ornithodoros屬之 軟蜱可感染蛇、蜥蜴和龜。
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包涵體病
病因: family Retroviridae。
症狀: IBD沒有特殊的臨床症狀，任何蚺科蛇類出現 急性的 神經症狀或
是 慢性漸進性的衰弱就可懷疑是IBD的感染，特別在 蟒科。
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殼的淺層與深層潰瘍
病因：感染、 營養不良以及 外傷為最常見的原因。通常感染的主因可以區分 細菌性與 黴菌性的兩種。偶有發生健康水龜的病例，大都與飼養的環境水質不良有關。
症狀：病患呈現衰弱，精神、食慾不佳；背甲的殼顏色呈黃 褐色，且按壓時呈鬆 軟狀，甚至可能出現 膿瘍情形。
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維生素A缺乏症以及維生素A過多症
維生素A缺乏症：
病因:
飲食中缺少維生素A。
症狀:
在龜類最主要的就是眼瞼 水腫，伴隨有黃 白色細胞殘餘物在眼瞼底下，可能一眼或是兩眼。
其他可能會出現厭食、昏睡、體重下降和鼻或眼有分泌物。
箱龜會有耳朵、呼吸道的感染以及卵滯留。年幼海龜眼瞼會過度角化。腹股溝和腋窩 水腫顯示出伴隨有 腎衰竭及預後不佳。
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蜥蜴的骨骼肌肉系統疾病
病因：
細菌性
敗血性關節炎
骨髓炎
蜂窩性組織炎
肌肉炎
黴菌性
寄生蟲性
嚴重 寄生蟲感染，特別是 血液寄生蟲( 貧血)或是 胃腸道 寄生蟲(原蟲類或是蠕蟲類)
營養性
代謝性骨病(MBD)
營養性繼發性副 甲狀腺亢進(飲食中鈣質缺乏、飲食中鈣磷比不均衡、維生素D3不足[缺乏紫外線照射或飲食中維生素D3攝取不足])
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