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癤瘡病
病原型別：細菌
病原環境：半鹹水，海水
學名： Aeromonas salmonicida
病名(及俗名)：Furunculosis, septicemia infection
最早發現者：Griffin et al. (1953)
OIE狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性, oxidase 陽性, catalasa陽性, 發酵葡萄糖, 兼性厭氧,
非運動性桿菌, 大小為1.3- 2.0 by 0.8- 1.3 μm (Inglish et al. 1993)。
非人畜共通。
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魚蝨感染症
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水、title="海水">海水
學名：Argulus foliaceus ; Argulus japonicus ; Argulus coregoni
病名(及俗名)：魚蝨感染症
最早發現者：
Argulus japonicus Thiele, 1900
Argulus foliaceus (Linnaeus), 1758
Argulus coregoni Thorell, 1865
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
魚蝨曾在17世紀時歐洲養殖的鱒魚及中國的 鯉魚發生過(Wilson,1902; Kabata,1985)。魚蝨在湖、河口及 海水鮭魚箱網都曾發生過且會造成死亡。在 鯉魚及金魚感染此病症後易繼發 黴菌及 細菌二次性感染，造成經濟上的損失(Shimura,1982a)。另外在1985年Ahne報告魚蝨亦為傳染SVC的媒介。Branchiurans亞綱裡，其蟲體型態為卵圓型，外層為 甲殼覆蓋。有一對 突出複眼，口器及觸角特化成勾型，有多刺的突起的吸盤，其構造是為了適應 寄生蟲生活。為了配偶及產卵，他們會離開宿主長達三個星期，然後在次附著魚的 鰓蓋內側，靠著黏液為生，然後蛻皮，或者是靠穿透 皮膚吸收內在養份為生。
人畜共通：非人畜共通
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鏈球菌感染症
病原型別：細菌( bacteria)
病原環境：主要於淡水或半淡鹹水(brackish water and freshwater), 但偶於海水環境。
學名：主要病原有 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiae and Lactococcus garvieae 等
鏈球菌感染症最早發生於1957年地點在日本養rainbow trout (Hoshina et al. 1958). 之後陸續多種魚種後其感染含 salmon, mullet, golden shiner,pinfish, eel, sea trout, tilapia, sturgeon, and striped bass 等 (Inglis et al. 1993)。
.於本省可感染多種養殖魚種如金目鱸giant seaperch ( Lates calcarifer) 、吳郭魚tilipia( Tilapia nilotica x Tilapia aurea)、午仔striped thread fish ( Polydactylus plebeius)、及海鱺cobia ( Rachycetron canadum) 烏魚mullet及條紋鱸等魚種。
國外發生魚種鏈球菌感染症於報告中常發生於較高水溫 (Nguyen et al. 2001)，此情行與本省南部養殖魚類鏈球菌感染症常發生於夏季高水溫之情形相似
病原摘要：
OIE 現：未表列(Not listed)
人畜共通：人畜共通 (如 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiaer 皆有感染人之病例)
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殼破損
病因： 外傷是造成殼破損的主因，有摔傷、踩踏傷害、汽機車或除草機的碰撞及狗的啃 咬傷等。
症狀：外觀上，殼明顯有破損或缺失的情形，偶有 出血的現象；嚴重者，可見內臟器官的暴露。
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殼的淺層與深層潰瘍
病因：感染、 營養不良以及 外傷為最常見的原因。通常感染的主因可以區分 細菌性與 黴菌性的兩種。偶有發生健康水龜的病例，大都與飼養的環境水質不良有關。
症狀：病患呈現衰弱，精神、食慾不佳；背甲的殼顏色呈黃 褐色，且按壓時呈鬆 軟狀，甚至可能出現 膿瘍情形。
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蛇的神經系統疾病
病毒性
包涵體病(Inclusion body disease(IBD)，C型反轉錄 病毒(C-type retrovirus)所造成)
里奧 病毒(Reovirus)
副黏液 病毒(Paramyxovirus)
Lentivirus
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蛇的眼科疾病
蛇的角膜有一層由上下眼瞼 融合而成的 透明保護膜，其視網膜雖具有錐狀細胞(cone)與桿狀細胞(rod)，但缺乏中央小窩(fovea)的構造。
蛇具有相當發達的哈氏腺(Harderian gland)，其分泌物除可提供潤滑的功能外，也會流入費洛蒙鼻嗅器(Vomeronasal organ)。
眼睛後房的檢查相當困難，主要是因為虹膜的 肌肉為橫紋肌且部分可受隨意自主控制，因此副交感 神經阻斷劑(parasympatholytics)如：atropine與擬交感 神經藥(sympathomimetics)如：phenylephrine皆無效果；也由於其角膜有一層由上下眼瞼 融合而成的 透明保護膜，此保護膜也會阻礙非副交感 神經阻斷性散瞳劑(non-parasympatholytic mydriatics)如：vecuronium吸收。詳細的眼科檢查建議在暗室中或全身麻醉下進行。
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