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殼病
病原型別： 細菌
病原環境： 海水
學名：
病名(及俗名)：Chitinolytic bacterial disease, Epizootic shell disease.
最早發現者：Malloy等(1978) 在 龍蝦發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
基丁質溶解革蘭氏陰性細菌及偽單孢菌( Pseudomonas), 弧菌( Vibrio) 及產黃桿菌科 ( Flavobacteriaceae)的細菌均被分離過。
人畜共通：否
2.病原分類
Pseudomonadaceae, Vibrionaceae, Flavobacteriaceae科， Cytophaga-，
Flavobacter 及 Alpha proteobacteria groups；Oceanobacillus，Staphylococcus屬.。
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梨形四膜蟲症
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水
學名： Tetrahymena corlissi、Tet. pyriformis、Tet. faurei、Tet. rostrata
病名(及俗名)：Tetrahymena infection、TET disease、Guppy disease
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
橢圓梨形小纖毛蟲(30-60 x 50-100 μm)，放射狀、對稱的體形，表面佈滿20-30排的纖毛縱列(Kinety)。 口腔內具有特殊的纖毛口器(oral ciliary apparatus)， 口腔右側具有側口膜(paraoral membrane)，三個連續排列的膜則位於左側。 口腔的底部為進食開口處(cytostome)。 口腔的後緣有一至三排纖毛縱列。繁殖採用二分裂法；但有些會產生生殖囊泡，內含二至八個幼蟲(tomite)。大部分對魚而言是機緣性寄生；少部分則為絕對寄生，引起魚類致死的寄生蟲。
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車輪蟲症
1.病原概述
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水及 海水
學名： Trichodina spp., Trichodinella spp.
病名(及俗名)：
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
車輪蟲科(Trichodinidae)內分七屬：Trichodina，Hemitrichodina，Vachomia，Paratrichodina，Tripartiella，Trichodinella，Dipartiella。型態大致相似，引起的病都叫做「車輪蟲症」。外表像一車輪，中央具有車軸。以週緣的纖毛運動。一般而言，大於90 um，寄生 皮膚者，有較多的寄生宿主；小於30 um寄生 鰓者，寄生較少的魚種。病原若離開魚體約可存活1到2天。
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流行性潰瘍症候群 (真菌性肉芽腫病)
病因： Aphanomyces invadans
症狀:是由 黴菌Aphanomyces invadans引起体表 潰瘍的疾病併發機會性病原Aeromonas hydrophila and A. sobria混合感染導致大量死亡.通常是季節性疾病感染 淡水魚和半鹼水魚
魚種：鯡魚 (menhaden) 等。
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兩棲類壺菌感染症
病原型別： 黴菌
病原環境： 淡水
學名： Batrachochytrium dendrobatidis
病名(及俗名)：Infection with Batrachochytrium dendrobatidis. Chytridiomycosis or cutaneous chytridiomycosis. Amphibian chytrid fungus, frog chytrid fungus, frog chytrid.
最早發現者：Longcore et al. (1999)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
該 黴菌菌體外觀為球狀且表面 粗糙之游動孢子囊 (直徑為5-40 μm)並具有1個或數個排出管而排出管開口朝向 皮膚表面，排出具有感染力的孢子。游動孢子囊於生長期會行成”根狀樣”結構(假根)。游動孢子外觀亦為球形且表面 粗糙(直徑為3-5 μm)，其前端具一鞭毛，於 淡水中具運動性。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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冷水病
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水
學名： Flavobacterium psychrophilum
病名(及俗名)：Cold water disease；fin rot；peduncle disease
最早發現者： Borg(1948)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性桿菌, oxidase陽性，catalas陽性，phosohatase陽性，ribonuclease陽性，好氧，直徑大小為1- 5 μm (Leadbetter, 1974;人畜共通：非人畜共通Bernardet et al., 1996)
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鮭弧菌
1.病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 海水
學名： Vibrio salmonicida
病名(及俗名)：冷水弧菌病（coldwater vibriosis）或Hitra disease
最早發現者：Egidius et al.1981
OIE狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性彎曲短桿菌，大小1.2～2.6×0.5μm，具運動性、極鞭毛、不形成孢子、兼性厭氧，oxidase及catalase反應陽性，但不具產生citrate、H 2S、urease、indole、arginine dihydrolase、gelatin、lysine decarboxylase、ornithine decarboxylase、β-galactosidase和voges-proskauer的能力。本菌具嗜鹽性及嗜冷性，在含0～4％(w/v)氯化鈉的條件下可生長，而於含7％(w/v)氯化鈉的條件下無法生長，另可在低於1℃的溫度下生長，最適合的生長溫度為15℃左右，而無法在37℃生長。對vibriostatic agent O/129敏感，但對 novobiocin 不敏感，可在海水中存活超過14個月[3,6]。
人畜共通：否
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愛德華氏病 (鰻魚肝腎病)
病因： Edwardsiella tarda
症狀：迴旋態游動而死亡，並可見魚隻張口， 鰓蓋怒開、貧血。 皮膚病灶、鰓部蒼白、 眼睛腫大、黏液過度分泌， 鱗片糜爛及 潰瘍。肛門 腫脹及 出血。在甚 急性病例，常見魚體腹側 皮膚充血Meyer and Bullock 1973; Padros et al 2006)。輕微的病例中，僅見魚體後側部 皮膚有小病灶，約3–5 mm寬。隨這病程進展， 軀幹肌肉開始有膿瘍灶的發生，之後 膿瘍灶會快速變大，產生大型空腔並充滿氣體。病灶處常有色素的流失(Sahoo et al 1998)。切開這些 膿瘍灶，會有腐臭味。隨後魚體的後半身會失去控之能力。
魚種：幾乎所有 淡水及 海水魚均會感染。
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鰻弧菌
1.病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 半鹹水， 海水、沈積物、海洋動物體表。
學名： Vibrio anguillarum
病名(及俗名)：鰻魚紅斑病
最早發現者：Hofer. (1904)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not Listed)
病原摘要：弧菌屬革蘭氏陰性彎曲短桿菌，可運動、具極鞭毛、不形成孢子、兼性厭氧、為 oxidase 反應陽性、嗜鹽性，適合於30℃，1.5% NaCl 的環境中生長[5]。
人畜共通：是
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腸炎弧菌
病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 半鹹水， 海水、沈積物、海洋動物體表。
學名： Vibrio paraheamolyticus
病名(及俗名)：腸炎弧菌
最早發現者：Sakazaki（1963）
ＯＩＥ狀況：未表列(Not Listed)
病原摘要：弧菌屬革蘭氏陰性彎曲短桿菌，可運動、具極鞭毛、不形成孢子、在端鞭毛無法作用下會於體側產生許多無鞘之側鞭毛，兼性厭氧、為 oxidase 反應陽性、嗜鹽性，環境中 NaCl 之含量低於 0.5 % 或高於 10% 均不能生長，對酸敏感但有耐鹼性，因此可在alkaline peptone water中培養，最適合之鹽濃度為 2-3 %，最適生長溫度為 37℃[5]。
人畜共通：是
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酸中毒
本病為環境性的疾病，多發於水質不良時，當水中pH值小於6時產生本病。在未污染的水域，水質酸化主要由於來至底土、森林、沼澤及溼地釋放的碳酸及有機酸。酸雨或於水沖刷的酸性土壤也會造成中毒。
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單殖類吸虫感染症
病原：吸蟲（Trematoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine、brackish & freshwater）
學名：單殖類吸虫（monogeneans）有有數千種類主要感染養殖及野生 海水及 淡水魚體之 鰓部、 皮膚及各鰭部，有些品種可寄生兩棲龜類之 口腔與膀胱，有極少數種屬則寄生於 魚類胃腸及 體腔，如寄生於慈鯛 魚類Etroplus suratensis 胃中的腸環虫（ Enterogyrus spp.）或寄生於義大利菱 鯛科Caproidae 魚類胃中的副雙絞穴虫（ Paradiplectanotrema spp.）。另有一種單殖類感染頭足類（cephalopods， 軟體動物），另有一品種（ Oculotrema hippopotami）感染河馬（hippopotamus） 眼睛；同樣有少數屬種寄生於 淡水魚虱上的後環指虫（ Metagrodactylus spp.）；故其學名無法統一描述，以下將重要常見 海水及 淡水單殖類吸虫陳述於後。
病名（及俗名）：單殖類吸虫感染症（momgeneans infestation）
最早發現者：人類所發現第一種單殖吸虫是Muller在1770於丹麥 Hippoglossus vulgaris魚體上發現，當時以為是一種水蛭，並命名為 Hirudo hippoglossi ；直到1818年，才由Blainville訂正，命名為內吸虫（ Entobdella hippogossi）。
OIE狀況：有一種單殖類 大西洋鮭魚<三代虫（ Gyrodactylus salaris.）
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殼的淺層與深層潰瘍
病因：感染、 營養不良以及 外傷為最常見的原因。通常感染的主因可以區分 細菌性與 黴菌性的兩種。偶有發生健康水龜的病例，大都與飼養的環境水質不良有關。
症狀：病患呈現衰弱，精神、食慾不佳；背甲的殼顏色呈黃 褐色，且按壓時呈鬆 軟狀，甚至可能出現 膿瘍情形。
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中華鱉虹彩病毒病
病原摘要：
中華鱉病毒(TSV)，病毒類粒呈正二十面體，無囊膜，直徑約為30nm，病毒結構蛋白由5條多?組成，分子量分別為85、60、55、18及12kb，其中以18kb含量最多，其次為12kb。人工接種於3至4天後，鱉體表開始顯現出血點，4至5天開始死亡，2至3周內全部死亡。病毒對氯仿、酸(PH3)、鹼(PH9)、200mg/l 次氯酸鈉(sodium hypochlorite)、或加熱60℃15分鐘敏感；病毒在1分鐘溶液內含有150mg/l chlorhexidine(0.75% NolvasanR)、180mg/l次氯酸鈉(3% bleach)或200mg/l 過一硫酸鉀(potassium peroxymonosulfate, 1% VirkonR) 不活化。
人畜共通︰無〔中華鱉，Pelodiscus(Trionyx)sinensis, 屬於爬虫網、龜鱉目(Testudinata)、(有11屬, 鱉科(Trionychidae)、鱉屬(Trionyx)〕
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