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偽單胞菌感染症
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 淡鹹水及 海水
學名： Pseudomonas fluorescens及 Pseudomonas anguilliseptica.
病名(及俗名)： 偽單胞菌敗血症Pseudomonad septicaemia ( P. fluorescens)，紅點病（赤點病）red spot disease 或 red pest ( P. anguilliseptica)。
最早發現者：Plehn (1924) 在鯉魚發現P. fluorescens。Wakabayashi (1972)在日本鰻發現P. anguilliseptica。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
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親水性產氣單胞菌
病原型別： 細菌
病原環境：淡 海水皆會發生
學名： Aeromonas hydrohlila
病名(及俗名)：motile Aeromonas spp., red fin disease
最早發現者：Schaperclaus (1930)
OIE狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
Aeromonas hydrophila為革蘭氏陰性桿菌，因具有極性的單鞭毛，使其具有移動性。此種 細菌的直徑大小為0.3-1.0μm，長度為1.0-3.5μm，不具芽孢及莢膜。理想生長溫度為28℃，但於37℃下亦可生長。於培養基上的生長菌落顏色介於 白色至淡 粉紅色，圓型凸面且邊緣明顯。
人畜共通：人畜共通傳染病
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鮑魚凋萎綜合症
病原概述
病原型別：立克次氏體
病原環境：海水
學 名：Candidatus Xenohaliotis californiensis
病名(及俗名)：鮑魚立克次氏體病(abalone rickettsiosis)
最早發現者：Gardner(1995)
ＯＩＥ狀況：表列(listed)
病原摘要：
本病原屬立克次氏體科(Rickettsiaceae)，革蘭式陰性、不具運動性、細胞內寄生菌，菌體呈多型態，由桿狀(332x1550nm)或橢圓狀(1405nm，78-1290nm)。
人畜共通：非人畜共通傳染病
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河鯰病毒病
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水
學 名： Ictalurid herpesvirus 1
病名(及俗名)：Channel catfish virus disease
最早發現者：發現於1968年 病毒確認於1971年
OIE狀況：未表列(Not Listed)
河鯰 病毒病為一病程迅速且具高度傳染性的 病毒性疾病，發生於養殖的幼年河鯰。
本病非人畜共通傳染病
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卵圓鞭毛蟲
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 半鹹水、 海水
學名： Amyloodinium ocellatum
病名(及俗名)：卵圓鞭毛蟲感染症(Amyloodiniasis)、絲絨病(Velvet disease)、銹病(Rust disease)、金粉症(Gold rust disease)
最早發現者：Brown, (1931)
ＯＩＥ狀況：非表列(Not Listed)
病原摘要：
卵圓鞭毛蟲 營養體以碟狀構造吸附於宿主，此碟狀構造具有一非常短的柄，且於吸盤的周圍有一圈 絲狀的假根可深入宿主的上皮細胞，ㄧ觸手狀的構造自細胞基底部延伸出，其功能尚未明瞭，細胞質缺乏葉綠粒但具有消化食泡及澱粉顆粒和多種特殊胞器， 營養體呈梨狀或卵圓狀，體長約150~350 um。
人畜共通：非人畜共通
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心形蟲
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水
學名： Chilodonella hexasticha
病名(及俗名)：Chilodonellosis, Chilodonelliasis, Warmwater Chilodonelliasis
最早發現者：(Kiernik, 1909) Kahl, 1931
ＯＩＥ狀況：非表列(Not listed)
病原摘要：
蟲體呈扁平狀，後緣具缺痕，背側成圓凸狀，腹側則為平坦狀，腹側的纖毛呈兩群，右側的纖毛群成拱狀且較左側長，由5-7個動基體(kineties)所構成，而左側的纖毛由7-9個動基體組成且較筆直。 具可伸縮口器，其構造明顯且位於腹側，具有ㄧ個大核位於背側接近蟲體的末端，小核成卵圓狀位於大核旁，具有許多消化食泡及2~3個伸縮液泡，其大小約為長33.6-47.6 um (平均40.3 u)寬23.0-44.2 um(平均33.0 um)具大型的核約7.8-13.3 um x 7.8-12.3 um，許多文獻提到其大小變化甚巨
人畜共通：非人畜共通傳染病
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鏈球菌感染症
病原型別：細菌( bacteria)
病原環境：主要於淡水或半淡鹹水(brackish water and freshwater), 但偶於海水環境。
學名：主要病原有 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiae and Lactococcus garvieae 等
鏈球菌感染症最早發生於1957年地點在日本養rainbow trout (Hoshina et al. 1958). 之後陸續多種魚種後其感染含 salmon, mullet, golden shiner,pinfish, eel, sea trout, tilapia, sturgeon, and striped bass 等 (Inglis et al. 1993)。
.於本省可感染多種養殖魚種如金目鱸giant seaperch ( Lates calcarifer) 、吳郭魚tilipia( Tilapia nilotica x Tilapia aurea)、午仔striped thread fish ( Polydactylus plebeius)、及海鱺cobia ( Rachycetron canadum) 烏魚mullet及條紋鱸等魚種。
國外發生魚種鏈球菌感染症於報告中常發生於較高水溫 (Nguyen et al. 2001)，此情行與本省南部養殖魚類鏈球菌感染症常發生於夏季高水溫之情形相似
病原摘要：
OIE 現：未表列(Not listed)
人畜共通：人畜共通 (如 Streptococcus iniae， Streptococcus agalactiaer 皆有感染人之病例)
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病毒性神經壞死病
描述
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 海水
學名：
病名(及俗名)：病毒性神經壞死病(viral Nervous Necrosis；VNN)，病毒性腦病及視網膜病(Viral encephalopathy and retinopathy；VER)
最早發現者：Bellance及Gellet de Saint Aurin(1988)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
無封套，直徑約20nm-35nm，呈二十面體結構，內含有兩條正向單股RNA分子，分子量分別為Mr1.17和0.48。於酸性環境中穩定，而60℃下1小時即失去活性。(莊蕙菁，2005)
人畜共通：No
病原分類
2.病原分類
Nodaviridae科， betanodavirus屬，海水魚神經壞死病毒分離株比對外鞘蛋白質基因序列 ( T4 )，可分成 ( SJ ) NNV、( TP ) NNV、( BF ) NNV、( RG ) NNV四種基因型，用交叉中和反應檢測四種NNV基因型之間的血清類源關係，分成三種血清型：SJNNV為一型，TPNNV為一型，BFNNV和RGNNV 則歸在一型，然而BFNNV的宿主皆為冷水魚，而RGNNV的宿主皆為溫水魚。台灣目前所有的分離株皆屬於RGNNV基因型。(中華民國水產種苗協會，2006)
別名：
命名沿革：1992年日本條紋鰺中發現類VNN病例，命名為條紋鰺神經壞死病毒(striped jack nervous necrosis virus,SJNNV)，魚類因病毒感染不同魚種而有不同的疾病名稱，如歐洲養殖鮃魚的腦炎(encephalo-myelitis)、法國海鱸和挪威大西洋比目魚的病毒性腦病及視網膜病變(Viral encephalopathy and retinopathy；VER)及法國海鱸的魚類腦炎(fish encephalotis)。
疾病特性
感染路徑：本病除可藉由種魚垂直感染及病魚水平傳染外，亦可藉由食入帶原病毒之生物餌料及養殖池所使用的網具和桶子而相互感染。(Skliris GP，1998)
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海水性四膜纖毛蟲症
1.病原概述
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 海水
學名： Uronema marinum
病名(及俗名)：海水性四膜纖毛蟲症，又名海洋尾絲蟲症
最早發現者：Thompson and Moewus（1964）
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：此纖毛蟲呈橢圓形或梨形，尾部有纖毛，故有文獻譯名為海洋尾絲蟲，大小約30-50μm。
人畜共通：No
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草魚里奧病毒症
1.病原型別： 病毒（Virus）
病原環境： 淡水（freshwater）
學名：Grass carp reovirus
病名（及俗名）： 草魚出血性 病毒症（Grass carp hemorrhagic virus GCHV）， 魚類里奧 病毒症（Fish reovirus）
最早發現者：未詳（1984）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
病毒為20面體和5：3：2對稱之球形顆粒，直徑為65至72nm，具雙層蛋衣殼、無外膜，外周有20個殼粒、核心直徑約在50nm， 病毒基因組由11條雙股RNA片段組成，總分子量為1.5×107Da，各片段分子量介於3.0×106～0.5×106Da問，第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級分別包含有3、3、3、2個片段； 病毒耐酸（pH3）、耐鹼（ph10）、耐熱（56℃）；對氯仿、乙醚等溶劑不敏感。能在宿主細胞質中複製，最適溫度為25～28℃。
人畜共通：No
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柱狀病
1.病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 海水
學 名： Flexibacter columnaris
病名(及俗名)：爛鰓病
最早發現者：Davis (1922)
ＯＩＥ狀況： 未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性桿菌，無鞭毛但具運動能行滑走運動，菌體大小約0.3~0.5x3.5~12μm於半固體性培養基(Cytophaga media)上培養可產生 黃色或淡黃色且邊緣 不規則樹枝樣菌落。
人畜共通：否
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蛙病毒感染症
1.病原概述
病原型別： 病毒
病原環境： 淡水
學名：Frog Virus 3 (FV-3)
病名(及俗名)：蛙 病毒感染症、蛙 病毒病
最早發現者：Granoff, A., Came, P. E. and Breeze, D. C. (1966)
ＯＩＥ狀況：表列(Listed)
病原摘要：
病毒顆粒大，直徑介於120 至 300 nm，二十面體，直線型雙股DNA 病毒。 典型蛙 病毒基因組大小為100-210 kbp，環狀排列並且終端重複， 病毒可具封套(由細胞膜來)或不具封套（於細胞質內及核內複製時）。
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考克斯體
病原概述
病原型別：立克次體
病原環境： 淡水
學名： Coxiella cheraxi
病名(及俗名)： 螯蝦考克斯體感染症Crayfish systemic rickettsiosis
最早發現者：Schaperclaus (1930)
ＯＩＥ狀況：未表列病原摘要：
為立克次體(Rickettsiae)，革蘭氏陰性菌，絕對細胞內寄生(Weiss & Moulder ，1984)。非人畜共通傳染病。
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發光桿菌病
病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 海水
學名： Photobacterium damselae subsp. Piscicida
病名(及俗名)： Photobacteriosis
最早發現者：Gauthier et al., (1995)
ＯＩＥ狀況：非表列(Not Listed)
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氣泡病
病原概述
病原型別：非病原感染引起。
環境： 淡水、 海水環境皆會發生。
最早發現者：首由Gorham(1898)年提出(Roberts 2001)
ＯＩＥ狀況：未表列
摘要：氣泡病就是池水中含氮量、溶氧量或其它氣體過飽而引起 魚類氣體栓塞(gas embolism)的疾病。
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