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氨中毒
1.病因：Ammonia污染水路、池水及湖泊，可能經由有機及無機二種來源，有機的途徑包括：公眾的污水系統、局部及大規模的農業污染，水中 硝酸鹽及 亞硝酸鹽等的生物化學還原作用；而無機的途徑則包含：氣體工廠及植物煉碳廠及發電廠等之工業廢水。
在水中ammonia是以未解離氨（NH3）及解離氨（NH4+）兩種形式存在，其比例與 水溫及 PH值有很大的關聯，其毒性的作用因NH3非常容易通過組織的障壁，所以對魚的毒性很高，又氨對 腦有特別的親和性
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渦蟲病
1.病原概述
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 海水
學名： Ichthyophaga sp., Paravortex sp.
病名(及俗名)：Tubellarian infection、 黑點病Black Ich、Tang Turbellarian 、Black spot disease、Tang disease。
最早發現者：
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
本病由多個病原引起。蟲體呈 橢圓形、 皮膚有纖毛、具有兩個眼點。常見的病原Tang tubellarium（又名 Paravortex sp.），其生活史類似海水性白點蟲，寄生魚體6天後（大小由77 μM 變成450 μM），會離開宿主落入池底，進行3-4天增殖，大小變為750 μM；同時仔蟲也在體內孵育，最後成蟲裂開釋出聚感染性的幼蟲。在24.5oC時，完成一次生活史約需10天。另一種扁蟲 Ichthyophaga sp. 也被報導引起本病有關。
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指環蟲症
病因: Gyrodactylus spp. 及 Dactylogyrus spp. 兩者最為常見。
症狀: 活動亢進，泳態怪異，常會跳起水面或摩擦身體。魚體褪色，呼吸加快， 鰓蓋擴張，露出 腫脹、蒼白的鰓部。 皮膚會有散佈的 出血及 潰瘍灶。死亡率高。
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海水性四膜纖毛蟲症
1.病原概述
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 海水
學名： Uronema marinum
病名(及俗名)：海水性四膜纖毛蟲症，又名海洋尾絲蟲症
最早發現者：Thompson and Moewus（1964）
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：此纖毛蟲呈橢圓形或梨形，尾部有纖毛，故有文獻譯名為海洋尾絲蟲，大小約30-50μm。
人畜共通：No
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腸紅嘴病
病因： Yersinia ruckeri。
症狀：遲鈍、厭食，嘴部、 口腔、峽部及鰭基部皮下、 鰓絲出血、 腹部擴張、 腹水。眼球 突出、眼窩及虹膜 出血、眼球破裂。體色變暗、獨游、活動力下降。
魚種：虹鱒 ( Oncorhynchus mykiss)、大西洋鮭魚 ( Atlantic salmon)、太平洋鮭魚 (Pacific salmon) 及非 鮭科魚類，如銀側美洲鱥 (Emerald shiner, Notropis atherinoides)、鰷魚 (fathead minnows, Pimephales promelas)，金魚 (Goldfish, Carassius auratus)，白鱒 (whitefish, Coregonus spp.)，比目魚 (turbot, Scophthalmus maximus)， 鱸魚鱸魚 (seabass, Dicentrarchus labrax) 及鯛魚 (seabream, Sparus auratus)。
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香魚微孢子蟲症
1.病原型別：原蟲（protozoa）
病原環境： 淡水（freshwater）
學名： Glugea plecoglossi
病名（及俗名）： 香魚微孢子蟲症（Microsporidiosis of Ayu）或Glugeosis
最早發現者：Takahashi & Egusa（1977）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
微孢子蟲（microsporidia）之孢子呈棃形、卵 圓形及橢 圓形等，孢子平均大小5.8µm×2.1µm；內部構造須在電子顯微鏡下使可觀察清楚。孢子外面具有三層組成之孢膜，前端有一極帽（polar cap）、極泡的前部呈鬆散之 薄片狀，極絲或極管（polar filament或polar tube）呈管狀，基部附著於極帽口，具有附著盤（anchoring disc），極絲斜行穿過極泡（後極泡，posterior vacuole），其長約100µm，然後呈螺旋狀盤繞於孢質（sporoplasm）和極泡後部周圍，而盤繞的圈數可作為分類的依據，孢子末端膨大成杯狀或囊狀，有一極囊（polar capsule）大小為5.0～6.1µm×2.0～2.6µm，囊內有極核（polar nucleus）。
人畜共通：No
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頭洞症
1.病原型別：原虫（protozoa）
病原環境： 海水、 淡水（marine、freshwater）
學名： Hexamita spp.（旋核六鞭毛虫； Spironucleus vortens, Paull & Matthews,2001）
病名（及俗名）：旋核六鞭毛症（Spironuclosis）或六鞭毛虫症（Hexamitosis）、頭洞症（Hole in the Head, HITH）
最早發現者： Spironucleus vortens（Amlacher 1970, Molanr 1974, Paull & Matthews, 2001, R）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
本病原可感染 淡水及 海水熱帶觀賞 魚類，本虫體基本形態與六鞭毛虫類似，其滋養體（trophozoite）外形呈延長虫體而體後端形成緊貼狀，具有2個香腸型之旋核，位於虫體鄰近頂部而在虫體前端部位形成為馬靴形複合物，虫體最前端部有一馬靴形上核纖維輪廓，二個相對狹窄外形之胞口，從胞口處之尾部 突出長鞭毛。在電子顯微鏡下，與六鞭毛虫主要區別為延長的虫體上具有明顯側複合物脊（lateral compound ridge）及 週邊脊（peripheral ridge）、虫體後部區於 週邊脊處具有精心渦捲（elaborate swirls）及每一鞭毛末端基部含有乳突狀構造（papilla），且第一鞭毛平展最末端含有一小球莖（small bulb）（R）。
人畜共通：No
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發光桿菌病
病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 海水
學名： Photobacterium damselae subsp. Piscicida
病名(及俗名)： Photobacteriosis
最早發現者：Gauthier et al., (1995)
ＯＩＥ狀況：非表列(Not Listed)
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分枝桿菌感染症
病原型別： 細菌
病原環境：淡、 海水
學名：Mycobacteriosis
病名(及俗名)： 魚類結核病(Fish tuberculosis; piscine tuberculosis)、游泳池 肉芽腫(Swimming Pool Granuloma)、水族館 肉芽腫(Fish Tank Granuloma)
最早發現者：Bataillon等人於1897年首次報告抗酸菌感染 淡水魚類（ 鯉魚）。
ＯＩＥ狀況：非OIE表列傳染病
人畜共通：人畜共通。
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魚類球蟲症
病原型別：原虫（Protozoa）
病原環境： 海水、半 淡水鹼水及 淡水（marine, brackish & fresh water）
學名：有多種球虫種類，目前文獻記載計有Cryptosporidium spp., Isospora spp., Octosporella spp., Calyptospora spp., Goussia spp., Crystallospora spp., Epieimeria spp., Eimeria spp., 計8種虫體，其中以艾美球虫（ Eimeria spp.）感染種類最多，依Duszynski et al., 2000報告，超過1300種艾美球虫，被感染約有500種變溫動物（包括 魚類、爬虫類及 兩棲類）。
病名（及俗名）： 魚類球虫症（Coccidiosis of fish、piscine coccidiosis）
最早發現者：Eimeria Schneider,（1875）；Goussia Labbe,（1896）；Octosporella Ray & Raghavachari,（1942）；Calyptospora Overstreet et al.,（1984）；Epieimeria Dykova & Lom,（1981）；Isospora, Schneider,（1881）；Crystallospora Labbe,（1899）；Cryptosporidium Tyzzen,（1907）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
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縧蟲感染症
病原：縧蟲（Cestoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 海水（marine、brackish & freshwater）
學名：例︰
(1)廣節裂頭縧蟲（ Diphyllobothrium latum）
(2)腸舌狀縧蟲（ Ligula intestinalis）
(3)鱊頭槽縧蟲（ Bothriocephalus acheilognathi）
(4)九江頭槽縧蟲（B. gowkongensis），同義於(3)之命名
(5) 其他縧蟲（Other cestodes）
病名（及俗名）：(1)鱊頭槽縧蟲稱為亞洲魚縧蟲（Asian fish tapeworm）或錦鯉縧蟲（Koi tapeworm）
(2)腸舌狀縧蟲稱為舌狀縧蟲病（Ligulosis）
最早發現者：例︰
(1)腸舌狀縧蟲 ( L. intestinalis )；Linnaeus 1758, Gmelin, 1790.
(2)鱊頭槽縧蟲 ( B. acheilog nathi ), Yamaguti, 1934.
(3)廣節裂頭縧蟲 ( D. latum ), Linnaeus, 1758.
OIE狀況：未表列（Not Listed）
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單殖類吸虫感染症
病原：吸蟲（Trematoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine、brackish & freshwater）
學名：單殖類吸虫（monogeneans）有有數千種類主要感染養殖及野生 海水及 淡水魚體之 鰓部、 皮膚及各鰭部，有些品種可寄生兩棲龜類之 口腔與膀胱，有極少數種屬則寄生於 魚類胃腸及 體腔，如寄生於慈鯛 魚類Etroplus suratensis 胃中的腸環虫（ Enterogyrus spp.）或寄生於義大利菱 鯛科Caproidae 魚類胃中的副雙絞穴虫（ Paradiplectanotrema spp.）。另有一種單殖類感染頭足類（cephalopods， 軟體動物），另有一品種（ Oculotrema hippopotami）感染河馬（hippopotamus） 眼睛；同樣有少數屬種寄生於 淡水魚虱上的後環指虫（ Metagrodactylus spp.）；故其學名無法統一描述，以下將重要常見 海水及 淡水單殖類吸虫陳述於後。
病名（及俗名）：單殖類吸虫感染症（momgeneans infestation）
最早發現者：人類所發現第一種單殖吸虫是Muller在1770於丹麥 Hippoglossus vulgaris魚體上發現，當時以為是一種水蛭，並命名為 Hirudo hippoglossi ；直到1818年，才由Blainville訂正，命名為內吸虫（ Entobdella hippogossi）。
OIE狀況：有一種單殖類 大西洋鮭魚<三代虫（ Gyrodactylus salaris.）
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