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氨中毒
1.病因：Ammonia污染水路、池水及湖泊，可能經由有機及無機二種來源，有機的途徑包括：公眾的污水系統、局部及大規模的農業污染，水中 硝酸鹽及 亞硝酸鹽等的生物化學還原作用；而無機的途徑則包含：氣體工廠及植物煉碳廠及發電廠等之工業廢水。
在水中ammonia是以未解離氨（NH3）及解離氨（NH4+）兩種形式存在，其比例與 水溫及 PH值有很大的關聯，其毒性的作用因NH3非常容易通過組織的障壁，所以對魚的毒性很高，又氨對 腦有特別的親和性
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黃麴毒素中毒
黃麴毒素中毒是由於動物對於黴菌中的黃麴菌屬 、Aspergillus parasiticus等之代謝產物的毒力作用具有感受性的一種疾病，這些黴菌在含的油質的植物上生長得最好；黃麴毒素的產生與黴菌生長一樣，受到飼料保存場所的一些環境因素影響（濕度、溫度及其他）；黃麴毒素為高耐熱性，可抵擋300℃的高溫，黃麴毒素有好幾種，其中以aflatoxin B1毒性最強。
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魚類立克次體症
1.病原概述
病原型別：細菌
病原環境： 淡水及海水
學名： Piscirickettsia salmonis
病名(及俗名)：Salmonid rickettsial septicemia (SRS), Coho salmon syndrome
最早發現者： Bravo等(1989).在智利發現本症，Fryer 等(1990, 1992)分離及正式命名。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：革蘭氏陰性、營養需求高、絕對魚類細胞質內生長的細菌。親緣關係上，它與Coxiella 及 Francisella 有些微親緣關係。.
命名沿革：最早由Fryer 等(1992) 命名 。
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殼病
病原型別： 細菌
病原環境： 海水
學名：
病名(及俗名)：Chitinolytic bacterial disease, Epizootic shell disease.
最早發現者：Malloy等(1978) 在 龍蝦發現。
ＯＩＥ狀況：未表列(Not listed)
病原摘要：
基丁質溶解革蘭氏陰性細菌及偽單孢菌( Pseudomonas), 弧菌( Vibrio) 及產黃桿菌科 ( Flavobacteriaceae)的細菌均被分離過。
人畜共通：否
2.病原分類
Pseudomonadaceae, Vibrionaceae, Flavobacteriaceae科， Cytophaga-，
Flavobacter 及 Alpha proteobacteria groups；Oceanobacillus，Staphylococcus屬.。
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細菌性鰓病
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水
學名： Flavobacterium branchiophilum
病名(及俗名)：Bacterial gill disease (BGD)
最早發現者：Davis (1926)
ＯＩＥ狀況：未表列(Not Listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性桿菌，型態彎曲，長度1μm ~5μm，菌落通常呈橘 黃色，其生化特性oxidase試驗為陰性, phosphatase試驗為陰性而ribonuclease試驗則為陽性。
人畜共通：非人畜共通
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心形蟲
病原型別： 寄生蟲
病原環境： 淡水
學名： Chilodonella hexasticha
病名(及俗名)：Chilodonellosis, Chilodonelliasis, Warmwater Chilodonelliasis
最早發現者：(Kiernik, 1909) Kahl, 1931
ＯＩＥ狀況：非表列(Not listed)
病原摘要：
蟲體呈扁平狀，後緣具缺痕，背側成圓凸狀，腹側則為平坦狀，腹側的纖毛呈兩群，右側的纖毛群成拱狀且較左側長，由5-7個動基體(kineties)所構成，而左側的纖毛由7-9個動基體組成且較筆直。 具可伸縮口器，其構造明顯且位於腹側，具有ㄧ個大核位於背側接近蟲體的末端，小核成卵圓狀位於大核旁，具有許多消化食泡及2~3個伸縮液泡，其大小約為長33.6-47.6 um (平均40.3 u)寬23.0-44.2 um(平均33.0 um)具大型的核約7.8-13.3 um x 7.8-12.3 um，許多文獻提到其大小變化甚巨
人畜共通：非人畜共通傳染病
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台灣異形吸虫症
病原型別：吸虫（Trematodes）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine, brackish ＆ freshwater）
學名： Centrocestus formosanus
病名（及俗名）：台灣異形吸虫症（ Centrocestus formosanus infection），異形吸虫症（Heterophylosis、Centrocestiasis）
最早發現者：Nishigori et al.（1924）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
本吸虫體之大小為0.36mm×0.179mm，前後兩列頭棘，大小不等各有16支，共有32支，子宮內卵子數約10至20個左右，卵殼外表呈格子狀斑紋，寄生於終宿主之小腸特別是十二指腸，而第二中間宿主為 淡水魚類，以其 鰓絲為主要危害器官。
人畜共通：目前異形科（Heterophyidae）內的吸虫，感染人體的報告共有5種，包括台灣異型吸虫（ Centrocestus formosanus Nishigori, 1924）
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淡水性白點虫病
病原型別：原虫（protozoa）
病原環境： 淡水（freshwater）
學名： Ichthyophthirius multifiliis
病名（及俗名）：Ichthyophthiriasis, white spot disease
最早發現者：Kabate et al.（1985）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
病原摘要：
成虫為球形或卵 圓形，大小為0.3～0.8×0.35～0.5cm，虫體表有分佈均勻的纖毛，胞口近於前端腹面，呈約6字形，虫體內具有１馬蹄形狀大核及1個球狀小核，胞質外層具有許多小伸縮泡和食物泡。幼虫呈卵形或橢 圓形，前端尖、後端圓，前端具有1個乳突狀鑽孔器，全身被有等長之纖毛、後端有1根粗而長的尾毛，大核呈卵形或橢 圓形、小核呈球形狀，一般在虫體前半部。
人畜共通：No
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柱狀病
1.病原概述
病原型別： 細菌
病原環境： 淡水、 海水
學 名： Flexibacter columnaris
病名(及俗名)：爛鰓病
最早發現者：Davis (1922)
ＯＩＥ狀況： 未表列(Not listed)
病原摘要：
革蘭氏陰性桿菌，無鞭毛但具運動能行滑走運動，菌體大小約0.3~0.5x3.5~12μm於半固體性培養基(Cytophaga media)上培養可產生 黃色或淡黃色且邊緣 不規則樹枝樣菌落。
人畜共通：否
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阿米巴原蟲感染症
病原型別： 寄生蟲
病原環境：淡、 海水
學名：Amoebosis
ＯＩＥ狀況：非表列
人畜共通：非人畜共通
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魚類球蟲症
病原型別：原虫（Protozoa）
病原環境： 海水、半 淡水鹼水及 淡水（marine, brackish & fresh water）
學名：有多種球虫種類，目前文獻記載計有Cryptosporidium spp., Isospora spp., Octosporella spp., Calyptospora spp., Goussia spp., Crystallospora spp., Epieimeria spp., Eimeria spp., 計8種虫體，其中以艾美球虫（ Eimeria spp.）感染種類最多，依Duszynski et al., 2000報告，超過1300種艾美球虫，被感染約有500種變溫動物（包括 魚類、爬虫類及 兩棲類）。
病名（及俗名）： 魚類球虫症（Coccidiosis of fish、piscine coccidiosis）
最早發現者：Eimeria Schneider,（1875）；Goussia Labbe,（1896）；Octosporella Ray & Raghavachari,（1942）；Calyptospora Overstreet et al.,（1984）；Epieimeria Dykova & Lom,（1981）；Isospora, Schneider,（1881）；Crystallospora Labbe,（1899）；Cryptosporidium Tyzzen,（1907）
OIE狀況：未表列（Not Listed）
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橈腳類感染症
病原型別：節肢動物， 甲殼類之橈腳 寄生蟲（Copepods）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine, brackish & fresh water）在台灣至少有四種以上病原
學名：(1) 淡水魚虱（freshwater fish lice, Argulus spp.）
(2) 海水魚虱（sea lice, Caligus spp.）
(3)錨頭蟲（針蟲）（Anchorpin worrn, Lernea spp.）
(4) 鰓魚蛆蟲（gill maggots, Ergasilus spp.）
病名（及俗名）：(1) 淡水魚虱症（freshwater fish lice disease, Argulosis）
(2) 海水魚虱症（sea lice disease; Caligosis）
(3)錨蟲症（Anchor worm disease, Lernaeosis）
(4) 鰓魚蛆症、鰠感染症（Gill maggots disease; Ergasilosis）
最早發現者：(1)O.F. Muller, 1785
(2)O.F. Muller, 1785
(3)C. Linnaeus, 1758
(4)Von Nordmann, 1832
OIE狀況：未表列（Not Listed）
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單殖類吸虫感染症
病原：吸蟲（Trematoda）
病原環境： 海水、半淡鹼水及 淡水（marine、brackish & freshwater）
學名：單殖類吸虫（monogeneans）有有數千種類主要感染養殖及野生 海水及 淡水魚體之 鰓部、 皮膚及各鰭部，有些品種可寄生兩棲龜類之 口腔與膀胱，有極少數種屬則寄生於 魚類胃腸及 體腔，如寄生於慈鯛 魚類Etroplus suratensis 胃中的腸環虫（ Enterogyrus spp.）或寄生於義大利菱 鯛科Caproidae 魚類胃中的副雙絞穴虫（ Paradiplectanotrema spp.）。另有一種單殖類感染頭足類（cephalopods， 軟體動物），另有一品種（ Oculotrema hippopotami）感染河馬（hippopotamus） 眼睛；同樣有少數屬種寄生於 淡水魚虱上的後環指虫（ Metagrodactylus spp.）；故其學名無法統一描述，以下將重要常見 海水及 淡水單殖類吸虫陳述於後。
病名（及俗名）：單殖類吸虫感染症（momgeneans infestation）
最早發現者：人類所發現第一種單殖吸虫是Muller在1770於丹麥 Hippoglossus vulgaris魚體上發現，當時以為是一種水蛭，並命名為 Hirudo hippoglossi ；直到1818年，才由Blainville訂正，命名為內吸虫（ Entobdella hippogossi）。
OIE狀況：有一種單殖類 大西洋鮭魚<三代虫（ Gyrodactylus salaris.）
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殼破損
病因： 外傷是造成殼破損的主因，有摔傷、踩踏傷害、汽機車或除草機的碰撞及狗的啃 咬傷等。
症狀：外觀上，殼明顯有破損或缺失的情形，偶有 出血的現象；嚴重者，可見內臟器官的暴露。
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蛇的眼科疾病
蛇的角膜有一層由上下眼瞼 融合而成的 透明保護膜，其視網膜雖具有錐狀細胞(cone)與桿狀細胞(rod)，但缺乏中央小窩(fovea)的構造。
蛇具有相當發達的哈氏腺(Harderian gland)，其分泌物除可提供潤滑的功能外，也會流入費洛蒙鼻嗅器(Vomeronasal organ)。
眼睛後房的檢查相當困難，主要是因為虹膜的 肌肉為橫紋肌且部分可受隨意自主控制，因此副交感 神經阻斷劑(parasympatholytics)如：atropine與擬交感 神經藥(sympathomimetics)如：phenylephrine皆無效果；也由於其角膜有一層由上下眼瞼 融合而成的 透明保護膜，此保護膜也會阻礙非副交感 神經阻斷性散瞳劑(non-parasympatholytic mydriatics)如：vecuronium吸收。詳細的眼科檢查建議在暗室中或全身麻醉下進行。
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甲魚分枝桿菌
分枝桿菌症於爬行動物和兩棲動物是一古老的傳染病，通常分枝桿菌會造成 肉芽腫嚴重反應，但偶爾可由非 肉芽腫病變部位分離出 Mycobacterium spp.。
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大西洋鮭魚三代蟲症
為單殖類（monogenea）吸蟲、胎生。一般體長約為0.5mm，身體延長而背腹扁平，具1對頭器，每個頭器尖端有1小刺，咽喉兩側有一些單細胞頭腺，有腺管通到頭器並開口於體外。在蟲體後端面有1個圓盤狀後固著器，不具眼點，蟲體中央有1對錨鉤，兩錨鉤間背腹面各有1根連結棒；後固著器邊緣有排列整齊之16個邊緣小鉤；身體後半部有1個卵巢，卵巢前身體中部有1個膨大的子宮，子宮內有1個橢圓胚胎，胚胎內還有第二代或第三代胚胎，所以名為三代蟲，卵巢之後有1個精巢。
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